1999 Fiscal Year Annual Research Report
DNA4重鎖構造を反応場とする金属酵素類似反応系の構築
Project/Area Number |
11640563
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Research Institution | Kyoto Institute of Technology |
Principal Investigator |
田嶋 邦彦 京都工芸繊維大学, 繊維学部, 教授 (50163457)
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Keywords | ポルフィリン / 四重鎖構造 / G-カルテット / 金属挿入反応 / 核磁気共鳴法 / 円二色性分光 |
Research Abstract |
多数見出されているポルフィリン結合性-本鎖DNAの中で、最も優れた金属イオン挿入反応活性を有する塩基配列はTCGTG GGTCA TTGTG GGTGG GTGTG GCTGG TCCの33量体である。本研究では、触媒活性と塩基配列の関連を解釈するために系統的な塩基配列を合成した。(1)この配列の1部分を切り出した短鎖の塩基配列の合成。(2)本配列に数個含まれるCおよびAに着目し、それらをTあるいはG等に置換した33量体の合成。(3)安定なグアニン4重鎖を形成する既知の配列にCあるいはA導入した新規配列の合成。金属イオン挿入反応の解析は、既存の高速液体クロマトグラフを使用して実施した。CDスペクトル測定によって,これらの配列は平行および反平行型4重鎖構造を示し,後者に高い触媒活性が認めらた。さらに、このG4重鎖構造を形成する条件でNMM(Nメチルメソポルフィリン)を添加すると、グアニン4重鎖-イミド水素の高磁場シフトおよびヘムのプロピオン酸残基に及ぼすグアニンからの環電流効果等によるケミカルシフトの変化が認められた。これは,ポルフィリンがG4重鎖とインターカーレーションによって強く相互作用している可能性を示唆している。金属イオン挿入反応の過程では,グアニン4重鎖構造が作り出す疎水環境場が重要な役割を果たしていることが明らかされた。
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Research Products
(5 results)
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[Publications] Kenji Kanaori: "Structure and stability of consecutive stereoregulated chiral phosphorothioate DNA duplex"Biochemistry. 38. 16058-16066 (1999)
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[Publications] Toshinori Suzuki: "Isolation and characterization of diazoate intermediate upon nitrous acid and nitric oxide treatment of 2'-deoxycytidine"Biochemistry. 38. 7151-7158 (1999)
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[Publications] Toshinori Suzuki: "Formation of 2'-deoxyguanosine and nitrous acid: mechanism and intermediates"Nucleic Acids Research. 28. 544-551 (2000)
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[Publications] Yuji Kajikawa: "Crystallographic and ESR Studies of π-π Stacked Binuclear Copper(II) Complexes of 1,3-Bis(quinoline-2-carboxamido) and 1,3-Bis(isoquinoline-3-carboxamido) propane,"Inorganica Chimica Acta. 288. 90-100 (1999)
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[Publications] Shin'ichi Nakatsuji: "Preparation and properties of biradicals and related CT complexes based on 4-substituted-amino-TEMPO radicals"Mol.Cryst.,and Liq.Cryst.,. 334. 205-210 (1999)