1999 Fiscal Year Annual Research Report
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11640624
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| Research Institution | The Institute of Statistical Mathematics |
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Principal Investigator |
長谷川 政美 統計数理研究所, 予測制御研究系, 教授 (60011657)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
橋本 哲男 統計数理研究所, 調査実験解析研究系, 助教授 (50208451)
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| Keywords | ミトコンドリア / カメ / 羊膜類 / 最尤法 / 真獣類 / 翼手類目 / 食虫目 |
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| Research Abstract |
ミトコンドリアのゲノムデータと核遺伝子の配列データを用いて、爬虫類の系統関係、特にカメ類の羊膜類の中での位置付けを調べた。これまでの研究から、ミトコンドリアと核とで支持する系統樹が食い違っていることが問題になっていたが、現在可能な最も現実的と思われるモデルに基づいて最尤法で解析すると、実は2つの系統樹の間に統計的に有意な差がないことが分かった。従って、モデルが現実と大きく食い違っている場合には、あるモデルに基づいた解析が特定の系統樹を強く支持したとしても、それが間違っている恐れがあることが明らかになった。一般には、いくつかの遺伝子の配列データをつなぎ合わせたデータ(concatenated sequence)について、座位間の進化速度の違いをガンマ分布で近似して解析することが多いが、モデルとデータとの適合度を高めるためには、遺伝子ごとにガンマ分布を仮定して最尤推定を行なって、その後で対数尤度を足し合わせて、総合評価を行なうべきであることが分かった。
また、ミトコンドリアのゲノムデータを用いて、翼手目と食虫目の真獣類における位置付けを検討した。その結果、翼手目と食虫目(アフリカのキンモグラは除く)は互いに近い関係にあって、このグループは、食肉目、奇蹄目、偶蹄クジラ目などと近縁な関係にあることが分かった。
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[Publications] Cao, Y., Hasegawa, M.: "Model dependence of the phylogenetic inference"Genes and Genetic Systems. 74. 211-217 (1999)
