2000 Fiscal Year Annual Research Report

DNAチップによる疾患原因の探索:リボソーム蛋白遺伝子マイクロアレイの開発

Research Project

Project/Area Number	11694300
Research Institution	University of the Ryukyus
Principal Investigator	剣持直哉琉球大学, 医学部, 助手 (00133124)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	田中龍夫琉球大学, 医学部, 教授 (70018688)
Keywords	リボソーム / DNAチップ / リボソームタンパク質遺伝子 / ゲノム / 疾患原因遺伝子 / マイクロアレイ
Research Abstract	最近になって、リボソームはタンパク質合成の単なる「場」ではなく、生命現象の発現をきわめて「動的」に制御していることを示唆する事実が発見された。また、リボソームの異常が種々の疾患に関与している可能性も示されている。本研究は、リボソームを構成するタンパク質のmRNAレベルでの発現を、DNAチップを用い網羅的に解析することを目的としている。本年度は、ハイブリダイゼーション用の新たなチップの開発とHeLa細胞を用いた発現プロファイルの解析を行った。 [結果] 1.ヒトリボソームの小サブユニットを構成するタンパク質遺伝子(33個)に特異的なプローブDNA(平均300bp)をPCRで作製し、コーティングしたガラススライドに固定した。また、PCRプライマーの末端にアミノ基を付加することにより、プローブDNAの固定効率を高めることに成功した。 2.HeLa細胞を用いて、熱ショック前後での発現の変動を調べた。両者で特に大きな変化は見られなかったが、胎盤のRNAをコントロールとして比較するとRPS17,RPS18,RPS24,RPS27で違いが見られた。このことより、培養がん細胞におけるRP遺伝子の発現プロファイルの変動が示唆された。今回は、前年度の実験に比較して強いシグナルが得られた。これは、RNAの標識法、ハイブリダイゼーションの条件、プローブDNAの長さを改良したためと考えられる。今後は、自前の検出システムの改良(ハードおよび解析ソフトの両面での)により、より高感度の検出が可能になると思われる。

Research Products
(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] 剣持直哉: "リボソームの分子解剖:超分子システムの遺伝子解析."バイオサイエンスとインダストリー. 11. 781-784 (2000)
[Publications] Kenmochi,N.: "The human ribosomal protein L6 gene in a critical region for Noonan syndrome."J.Hum.Genet.. 45. 290-293 (2000)
[Publications] Uechi,T.: "A complete map of the human ribosomal protein genes : Assignment of 80 genes to the cytogenetic map and implications for human disorders."Genomics. 72(in press). (2001)
[Publications] Kurg,A.: "Arrayed Primer Extension : Solid phase four-color DNA resequencing and mutation detection technology"Genetic Testing. 4・1. 1-7 (2000)
[Publications] Gasparini,P.: "High carrier frequency of the 35delG deafness mutation in European populations."Eur.J.Hum.Genet.. 8・1. 19-23 (2000)
[Publications] Tonisson,N.: "Unravelling Genetic Data by Arrayed Primer Extension."Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. 38・2. 165-177 (2000)
[Publications] Tonisson,N.: "DNA Microarrayes : Biology and Technology"BioTechniques Books. 16 (2000)

2000 Fiscal Year Annual Research Report

DNAチップによる疾患原因の探索:リボソーム蛋白遺伝子マイクロアレイの開発

Principal Investigator

剣持 直哉 琉球大学, 医学部, 助手 (00133124)

Research Products

[Publications] 剣持直哉: "リボソームの分子解剖:超分子システムの遺伝子解析."バイオサイエンスとインダストリー. 11. 781-784 (2000)

[Publications] Kenmochi,N.: "The human ribosomal protein L6 gene in a critical region for Noonan syndrome."J.Hum.Genet.. 45. 290-293 (2000)

[Publications] Uechi,T.: "A complete map of the human ribosomal protein genes : Assignment of 80 genes to the cytogenetic map and implications for human disorders."Genomics. 72(in press). (2001)

[Publications] Kurg,A.: "Arrayed Primer Extension : Solid phase four-color DNA resequencing and mutation detection technology"Genetic Testing. 4・1. 1-7 (2000)

[Publications] Gasparini,P.: "High carrier frequency of the 35delG deafness mutation in European populations."Eur.J.Hum.Genet.. 8・1. 19-23 (2000)

[Publications] Tonisson,N.: "Unravelling Genetic Data by Arrayed Primer Extension."Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. 38・2. 165-177 (2000)

[Publications] Tonisson,N.: "DNA Microarrayes : Biology and Technology"BioTechniques Books. 16 (2000)

剣持直哉琉球大学, 医学部, 助手 (00133124)