1999 Fiscal Year Annual Research Report

相同性をしめすヒト染色体領域の構造解析によるゲノムの成立と進化の解明

Research Project

Project/Area Number	11694317
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Research Institution	Tokai University
Principal Investigator	猪子英俊東海大学, 医学部, 教授 (10101932)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	安藤麻子東海大学, 医学部, 講師 (40101935)
Keywords	第1染色体1q21-25領域 / CD1遺伝子 / HLA領域 / 進化 / 相同遺伝子 / 遺伝子重複 / ゲノム構造
Research Abstract	ヒトの第6染色体6p21.3領域に位置するHLA領域と相同性を有する遺伝子が多数みいだされる第1染色体1q21-25領域のゲノム構造をHLA領域と比較、解析することにより、MHCの進化の起源と進化の過程を解明することを目的として、非古典的MHC遺伝子であるCD1遺伝子群を含む1q22-23領域の塩基配列を決定しつつある。今年度は、CD1遺伝子群からFCER1A遺伝子までの1Mbの領域をカバーする9つのBAC/PACクローンについて、ショットガン法により塩基配列を決定し、既知の遺伝子とのBLASTを用いたホモロジー解析ならびにGrailおよびGENSCANを用いたエクソンあるいは遺伝子の予測をそれぞれ行い、遺伝子を同定した。その結果、セントロメア側から、CD1D-CD1A-CD1C-CD1B-CD1E-SPTA1-MNDA-IFI16-FY-FCER1Aの順に10個の既知遺伝子が見い出された。また、これらの遺伝子に加えて、細胞接着分子であるBL1Aや匂い受容体遺伝子であるOLFA遺伝子ホモログなど6個の遺伝子が新たに同定された。特に、OLFA遺伝子はこの領域と相同染色体領域である6番、19番染色体上にも見い出されていることから、染色体4倍体化を解明する上で興味深いものと考えられる。さらに、CD1遺伝子領域におけるDot matrix解析をおこなった結果、CD1遺伝子間には、HLAクラスI領域に認められたような遺伝子重複の痕跡は認められなかった。したがって、CD1遺伝子群の形成は太古に起きたものと推測された。

Research Products
(8 results)

All Other

All Publications (8 results)

[Publications] Shiina T, et al.: "Molecular dynamics of MHC genesis unraveled by sequencing analysis of the 1,796,938 bp HLA class I region"Proc Natl Acad Sci USA. 96. 13282-13287 (1999)
[Publications] The MHC sequencing consortium(Aguado B,et al.): "Complete structure and gene map of a human major histocompatibility complex(MHC)"Nature. 401. 921-923 (1999)
[Publications] Oka A, et al.: "Association analysis using refined microsatellite markers localizes a susceptible locus for psonasis vulgaris within a 111 kb segment telomeric of the HLA-C gene"Hum Mol Genetics. 8. 2165-2170 (1999)
[Publications] Ota M,et al.: "The critical reqion for Behcet's disease in the human major histocompatlbility complex is reduced to a 46 kb segment centromeric of HLA-B, by association analysis using refined microsattellite mapping"Am J Hum Genet. 64. 1406-1410 (1999)
[Publications] Yamazaki M, et al.: "Genome organization around the centromeric end of theHLA class I region ; large-scale seqeuncing analysis"J Mol Evol. 48. 317-327 (1999)
[Publications] Shiina T, et al.: "Genome sequencing analysis of the 1.8 Mb entire human MHC class I region"Immunological Reviews. 167. 193-199 (1999)
[Publications] Yabuki K, et al.: "Dev Ophthalmol"Kargar. 15 (1999)
[Publications] Kanaya S, et al.: "Major Histocompatibility Complex; Evolution, Structure,and Function"Springer. 15 (2000)

1999 Fiscal Year Annual Research Report

相同性をしめすヒト染色体領域の構造解析によるゲノムの成立と進化の解明

Principal Investigator

猪子 英俊 東海大学, 医学部, 教授 (10101932)

Research Products

[Publications] Shiina T, et al.: "Molecular dynamics of MHC genesis unraveled by sequencing analysis of the 1,796,938 bp HLA class I region"Proc Natl Acad Sci USA. 96. 13282-13287 (1999)

[Publications] The MHC sequencing consortium(Aguado B,et al.): "Complete structure and gene map of a human major histocompatibility complex(MHC)"Nature. 401. 921-923 (1999)

[Publications] Oka A, et al.: "Association analysis using refined microsatellite markers localizes a susceptible locus for psonasis vulgaris within a 111 kb segment telomeric of the HLA-C gene"Hum Mol Genetics. 8. 2165-2170 (1999)

[Publications] Ota M,et al.: "The critical reqion for Behcet's disease in the human major histocompatlbility complex is reduced to a 46 kb segment centromeric of HLA-B, by association analysis using refined microsattellite mapping"Am J Hum Genet. 64. 1406-1410 (1999)

[Publications] Yamazaki M, et al.: "Genome organization around the centromeric end of theHLA class I region ; large-scale seqeuncing analysis"J Mol Evol. 48. 317-327 (1999)

[Publications] Shiina T, et al.: "Genome sequencing analysis of the 1.8 Mb entire human MHC class I region"Immunological Reviews. 167. 193-199 (1999)

[Publications] Yabuki K, et al.: "Dev Ophthalmol"Kargar. 15 (1999)

[Publications] Kanaya S, et al.: "Major Histocompatibility Complex; Evolution, Structure,and Function"Springer. 15 (2000)

猪子英俊東海大学, 医学部, 教授 (10101932)