薬物設計のための斬新的コンピュータ・シミュレーションに関する研究

1999 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 11695096
• Research Institution: Kobe Gakuin University
• Principal Investigator: 赤穂 栄一 神戸学院大学, 薬学部, 助教授 (50122239)
• Keywords: 酵素 / 阻害物質 / コンピュータ・ドッキング / 受容体 / コンピュータ・モデリング / 結合様式

Research Abstract

平成11年度の研究実地計画中にある炎症、発熱、疼痛に関与する酵素であるcyclooxygenaseI,II(Cox1,Cox2)及び発癌に関与するといわれているtyrosine kinaseをインターネットを介して蛋白データバンク(URL=http://www.rcsb.org/pdb/cgi/queryForm.cgi)からダウンロードした。それらをinsightIIを用いて、水素の付加、電荷の付加等を行いコンピュータドッキング可能な状態に編集した。そのcyclooxgenaseに対する阻害モードの探求と、Cox1(正常な生体機能を保持する良質の酵素と言われている)に影響を与えることなく、Cox2(炎症発現に関与する酵素であるといわれている)を阻害することを可能にするコンピュータドッキングの選択性の確定を完了し、次の頁に示すごとく、J.Chem.Softwareに投稿、受理,掲載された。Lck tyrosine kinaseにおいては文献(M.S.Smith et al,J.Med.Chem.1993,36,3010-3020)に報告されているlavendustin誘導体を用い、阻害モードを探索した。また、類似の阻害候補物質を24万種類の化合物を有するACD(Available Chemical Database)で検索したAC-SER-GLN-ASN-TYR-OHをコンピュータドッキングしたところ、その物質は阻害部位に対し12個の水素結合を有する優れた阻害物質であることが判明した。

Research Products

• [Publications] E.Akaho,C.Fujikawa,H.I.Runion,C.R.Hill,and H.Nakano: "A Study on Binding Modes of Nonsteroidal Antiinflammatory Drugs to Cox1 and Cox2 as Obtained by Dock4.0"The Journal of Chemical Software. 5・4. 147-162 (1999)