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2013 Fiscal Year Annual Research Report

リボソームの翻訳伸長停止と共役したmRNA分解 : 植物における新規転写後制御の研究

Research Project

Project/Area Number 11J01971
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

山下 由衣  北海道大学, 大学院生命科学院, 特別研究員(DC1)

Keywords翻訳アレスト / 翻訳伸長 / シロイヌナズナ
Research Abstract

本研究はS-アデノシルメチオニン(SAM)に応答して, シロイヌナズナのCGS1 mRNA上で起こる翻訳停止がmRNA分解を誘導する機構を明らかにすることを目的としている。この制御では, 翻訳停止したリボソームを認識してmRNA分解機構が働くと考えられるため, まずはじめに, 翻訳停止したリボソームの状態を明らかにすることを目指した。平成23と24年度はSAMによって翻訳停止したリボソームが抗生物質のピューロマイシンと反応しにくいことを明らかにした。平成25年度は, 翻訳停止したリボソームとピューロマイシンの反応性をさらに詳しく解析した。前年度よりもタイムポイントを増やし, 3秒~15分までに設けた17点を測定し, ピューロマイシン反応の速度を定量的に比較した。その結果, SAMによって翻訳停止したリボソームは転座前の状態で止まっていることが明らかになり, 先行研究を強く支持した。一方, SAMで翻訳停止したリボソームに追突した後続のリボソームのピューロマイシン反応は, 転座前と転座後の中間的な値を示した。この, 中間的なピューロマイシン反応速度から, 追突したリボソームの約6割が転座前, 約4割が転座後であることが明らかになった。以上の内容をまとめた学術論文は, Yui Yamashita et al., "Ribosomes in a Stacked Array"として, Journal of Biological Chemistry誌に採択され, 印刷中である。

Strategy for Future Research Activity

(抄録なし)

  • Research Products

    (7 results)

All 2014 2013

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Ribosomes in a Stacked Array : Elucidation of the Step in Translation Elongation at Which They Are Stalled During S-Adenosyl-L-methionine-Induced Translation Arrest of CGS1 mRNA2014

    • Author(s)
      Yui Yamashita, Yoshitomo Kadokura, Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara, Ichigaku Takigawa, Akiko Satake, Hitoshi Onouchi, and Satoshi Naito
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: (印刷中)

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.526616

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] SS-mPMG and SS-GA : tools for finding pathways and dynamic simulation of metabolic networks.2013

    • Author(s)
      Tetsuo Katsuragi, Naoaki Ono, Keiichi Yasumoto, Masami Y. Hirai, Kansuporn Sriyudthsak, Yuji Sawada, Yui Yamashita, Yukako Chiba, Hitoshi Onouchi, Toru Fujiwara, Satoshi Naito
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 54 Pages: 728-739

    • DOI

      10.1093/pcp/pct052

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A halt in poly(A) shortening during S-adenosyl-L-methionine-induced translation arrest in CGS1 mRNA of Arabidopsis thaliana2013

    • Author(s)
      Yui Yamashita, Ingrid Lambein, Soko Kobayashi, Hitoshi Onouchi, Yukako Chiba and Satoshi Naito
    • Journal Title

      Genes and Genetic Systems

      Volume: 88 Pages: 241-249

    • DOI

      10.1266/ggs.88.241

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] A halt in Poly(A) shortening during S-adenosyl-L-methionine-induced translation arrest in CGS1 mRNA of Arabidopsis2014

    • Author(s)
      山下由衣
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山大学(富山市)
    • Year and Date
      2014-03-21
  • [Presentation] CGS1 mRNAの翻訳制御におけるリボソームの停滞と新生ペプチドの収縮.2013

    • Author(s)
      山下由衣
    • Organizer
      第31回日本植物細胞分子生物学会大会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2013-09-10
  • [Presentation] S-アデノシルメチオニンはシロイヌナズナCGS1 mRNAにおける翻訳アレストに先立って新生ペプチドの収縮を引き起こす.2013

    • Author(s)
      山下由衣
    • Organizer
      第15回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      ひめぎんホール(愛媛県)
    • Year and Date
      2013-07-25
  • [Book] Translation elongation arrest induced by S-adenosyl-L-methionine-sensing nascent peptide in plants. In "Regulatory Nascent Polypeptides" (Ed. K. Ito)2014

    • Author(s)
      Yui Yamashita, Noriyuki Onoue, Katsunori Murota, Hitoshi Onouchi and Satoshi Naito
    • Publisher
      Springer(印刷中)

URL: 

Published: 2015-06-25  

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