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2012 Fiscal Year Annual Research Report

質量分析法によるタンパク質の翻訳後修飾解析

Research Project

Project/Area Number 11J10272
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

浅川 大樹  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 特別研究員(PD)

Keywords質量分析 / MALDI-ISD / 翻訳後修飾 / 水素転移反応
Research Abstract

マトリックス支援レーザー脱離イオン化質量分析法において、レーザー照射直後に起こるペプチドの分解反応:MALDIインソース分解におけるメカニズムについて研究を行った。
まず、昨年度発見した水素ラジカル引き抜き反応によるMALDIインソース分解を用いて従来の質量分析による解析では構造決定が困難な糖鎖の構造解析を試み、本法では糖鎖の結合位置決定に有用な情報が得られ、本手法は糖鎖の構造解析における重要な手法になりえることがわかった。この成果をAnalytical Chemistry誌に報告した。
このMALDIインソース分解はマトリックスとペプチドの水素ラジカル移動反応により生成したペプチドラジカルの分解反応であることが知られている。このペプチドラジカルの生成反応はレーザー照射によって、マトリックス結晶内でのみ起こることを明らかにし、Journal of Physical Chemistry B誌に報告した。また、ペプチドがシステイン残基を含む場合、これの側鎖にも水素ラジカル付加反応が起こり、ペプチド主鎖の切断が起こることを明らかにした。この成果をJournal of Mass Spectrometry誌に投稿し、表紙として採用された。さらに、レーザー照射により生成したペプチドラジカルの分解反応は、レーザー照射による脱離の際に起こる、試料分子-マトリックス分子の衝突が重要であることを明らかにした。衝突回数が少ない条件の場合、分解が優先的に起こり、質量分析では識別が困難なロイシン、イソロイシンの同定に利用できることがわかった。この成果をJournal of the American Society for Mass Spectrometry誌、およびInternational Journal of Mass Spectrometry誌に論文を報告した。これらの成果はMALDIインソース分解におけるマトリックス開発において、重要な指針を与える論文であると考えている。
さらにMALDIインソース分解と超高分解能質量分析計FTICRを組み合わせ、生体組織に存在するタンパク質の直接同定およびイメージング分析へと応用し、Analytical Chemistry誌に報告した。また、MALDIインソース分解のメカニズム、タンパク質のアミノ酸配列決定およびイメージング分析への応用についてのReviewを執筆し、Mass Spectrometry誌およびTopics in Current Chemistry誌に論文を掲載した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

マトリックス支援レーザー脱離イオン化質量分析の原理およびこれを利用したタンパク質の翻訳後修飾解析について、これまでに査読付学術雑誌に13件の原著論文を発表しており、当初の計画以上に進展していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

タンパク質の翻訳後修飾解析を行うために、質量分析法の原理の更なる理解が必要と考えている。本研究では最も重要な翻訳後修飾である「リン酸化」、および「糖鎖付加」についても研究を行っている。

  • Research Products

    (10 results)

All 2013 2012

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Ultraviolet Laser Induced Hydrogen Transfer Reaction : Study of the First Step of MALDI In-Source Decay Mass Spectromet2013

    • Author(s)
      D. Asakawa, D. Calligaris, N. Smargiasso, E. De Pauw
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 117 Pages: 2321-2327

    • DOI

      10.1021/jp311464k

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Selected Protein Monitoring in Histological Sections by Targeted MALDI-FTICR In-source Decay Imaging2013

    • Author(s)
      D. Calligaris, R. Longuespѐe, D. Debois, D. Asakawa, A. Turtoi, V. Castronovo, A. Noёl, V. Bertrand, M. -C. De Pauw-Gillet, E. De Pauw
    • Journal Title

      Anal. Chem.

      Volume: 85 Pages: 2117-2126

    • DOI

      10.1021/ac302746t

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Influence of Initial Velocity of Analytes on In-source Decay Products in MALDI Mass Spectrometry Using Salicylic Acid Derivative Matrices2013

    • Author(s)
      D. Asakawa, M. Sakakura, M. Takayama
    • Journal Title

      Int. J. Mass Spectrom.

      Volume: 337 Pages: 29-33

    • DOI

      10.1016/j.ijms.2012.12.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Discrimination of Isobaric Leu/Ile Residues by MALDI In-source Decay Mass Spectrometry2013

    • Author(s)
      D. Asakawa, N. Smargiasso, E. De Pauw
    • Journal Title

      J. Am. Soc. Mass Spectrom.

      Volume: 24 Pages: 297-300

    • DOI

      10.1007/s13361-012-0523-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Peptide Backbone Fragmentation Initiated by Side-chain Loss at Cysteine Residue in Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization In-source Decay Mass Spectrometry2013

    • Author(s)
      D. Asakawa, N. Smargiasso, L. Quinton, E. De Pauw
    • Journal Title

      J.Mass Spectrom.

      Volume: 48 Pages: 358-366

    • DOI

      10.1002/jms.3182

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] MALDI In-Source Decay, from sequencing to imaging2013

    • Author(s)
      D. Debois, N. Smargiasso, K. Demeure, D. Asakawa, T. Zimmerman, L. Quinton, E. De Pauw
    • Journal Title

      Top. Cur. Chem.

      Volume: 331 Pages: 117-141

    • DOI

      10.1007/1282012363.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification and Relative-Quantification of Glycans by Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization In-Source Decay with Hydrogen Abstraction2012

    • Author(s)
      D. Asakawa, N. Smargiasso, E. De Pauw,
    • Journal Title

      Anal.Chem.

      Volume: 84 Pages: 7463-7468

    • DOI

      10.1021/ac3014737.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Matrix Effect on In-Source Decay Products of Peptides in Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization2012

    • Author(s)
      D. Asakawa, M. Sakakura, M. Takayama
    • Journal Title

      Mass Spectrom.

      Volume: 1 Pages: A0002

    • DOI

      10.5702/massspectrometry.A0002

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] New insights in MALDI-ISD2012

    • Author(s)
      D. Asakawa, N. Smargiasso, E. De Pauw
    • Organizer
      19^<th> International Mass Spectrometry Conference
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2012-09-18
  • [Presentation] Fragmentation of Peptides via Hypervalent Radical in Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization In-Souce Decay Mass Spectrometry2012

    • Author(s)
      D. Asakawa, N. Smargiasso, E. De Pauw
    • Organizer
      60^<th> ASMS Conference on Mass Spectrometry
    • Place of Presentation
      Vancouver, BC, Canada
    • Year and Date
      2012-05-22

URL: 

Published: 2014-07-16  

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