2000 Fiscal Year Annual Research Report
多色蛍光標識プライマーを用いたSTR多座位同時増幅分析法による日本人起源の探究
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12012204
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
山本 敏充 名古屋大学, 医学部, 助教授 (50260592)
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| Keywords | STR / Multiplex PCR / Capillary electrophoresis / 集団遺伝学 / 日本人の起源 / 蛍光標識プライマー |
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| Research Abstract |
法医学の分野では、DNAによる個人識別や親子鑑定などのため、STR(Short Tandem Repeat)領域が最も汎用されている。これらを分析するために、多色蛍光標識プライマーを用いたMultiplex-PCR法を利用して開発されたキット(AmpFlSTR Profiler plus kitとCofiler kit)を用いて、13のローカス(D3S1358,vWA,FGA,TH01,TPOX,CSF1PO,D18S51,D21S11,D8S1179,D16S539,D5S818,D13S317,D7S820)が簡便に増幅・タイピングできる。この2つのキットを利用して計13STRローカスのアレル頻度を中国人5集団(陜西省108名、江蘇省119名、福建省116名、湖南省105名、広東省111名)及びタイ人(バンコク市183名)で算出した。昨年度までに各ローカスのアレル頻度を算出した日本人2集団(本土及び琉球)、韓国人(ソウル市)、中国人(北京市近郊)、ミャンマー人(ヤンゴン市)を含めた計11集団で、アレル頻度が比較的安定するといわれている100以上のサンプル数を用いて、計1493サンプルをタイピングした。この13ローカスのSTRのアレル頻度分布から遺伝距離DAを算出し、近隣結合法により系統樹を作成した。本土日本人と沖縄日本人で1つ、中国の北中部である北京市近郊、陜西省と江蘇省の集団で1つ、中国の南部である福建省、湖南省と広東省の集団で1つ、ビルマ人とタイ人で1つの同じクラスターを形成し、そのtopologyは現在の地理的分布をよく反映していた。
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[Publications] T.Yoshimoto: "A new triplex STR system without irregular alleles by silver staining and its potential application to forensic analvsis."J.Forensic Sci.. 46(in press). (2001)
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[Publications] T.Yamamoto: "The application of minisatellite variant repeat mapping by PCR (MVR-PCR) in a paternity case showing false exclusion due to STR mutation."J.Forensic Sci.. 46(in press). (2001)
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[Publications] M.Tanaka: "Usefulness of a toothbrush as a source of evidential DNA for typing."J.Forensic Sci.. 45(3). 674-676 (2000)
