2000 Fiscal Year Annual Research Report

高度好塩性古細菌の光駆動型エネルギー獲得系の人工アーキテクチャー

Research Project

Project/Area Number	12019218
Research Institution	Tokyo Institute of Technology
Principal Investigator	中村聡東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50227899)
Keywords	高度好塩性古細菌 / Haloarcula japonica / ハロロドプシン / クルックスロドプシン / PCR / 遺伝子クローニング / 転写制御 / ATP合成酵素
Research Abstract	高度好塩性古細菌Haloarcula japonicaのハロロドプシン(hR)様タンパク質(アニオンポンプ)遺伝子のPCR増幅と,そのPCR産物をプローブとして染色体からのクローニングを行った.類縁菌hR様タンパク質のアミノ酸配列に基づくコンセンサスPCRにより,本菌bR様タンパク質遺伝子を増幅した.さらに,このPCR産物をプローブとして用いることにより,hR様タンパク質遺伝子の染色体からのクローニングに成功した.染色体よりクローニングしたH.japonica hR様タンパク質遺伝子は828塩基からなるオープンリーディングフレームを含んでおり,276アミノ酸をコードしていた.遺伝子から類推されるアミノ酸配列を類縁菌hR様タンパク質と比較したところ,とりわけクルックスハロロドプシン(chR)と高い相同性を有しており,本菌hR様タンパク質はchRファミリーに属することが明らかとなった.chR遺伝子の転写は,他のイオンポンプ遺伝子の場合とは異なり,光照射により誘導され,低酸素分圧下においては誘導されないことが明らかとなった. また,既にクローニングしたH.japonicaクルックスロドプシン(cR;プロトンポンプ)遺伝子の発現制御遺伝子の検索を目的として,cR遺伝子上流域の解析を行った.その結果,その領域にはATP合成酵素遺伝子の一部が存在していることが明らかとなった.さらに,染色体ウォーキングを行い,ATP合成酵素遺伝子A1パート領域の取得に成功した.ATP合成酵素遺伝子の塩基配列決定により,そのアミノ酸配列を明らかにすることができた.

Research Products

(8 results)

All Other

All Publications (8 results)

[Publications] R.Yatsunami et al.: "A Novel Bacteriohodopsin-like Protein from Haloarcula japonica Strain TR-1 : Gene Cloning, Sequencing and Transcription Analysis"Extremophiles. 4. 109-114 (2000)
[Publications] D.Sugimori et al.: "Purification and Characterization of a Ferredoxin from Haloarcula japonica Strain TR-1"BioMetals. 13. 13-28 (2000)
[Publications] H.Takahashi et al.: "Purification and Some Properties of a Basic Xylanase Produced by Thermoalkaliphilic Bacillus sp. Strain TAR-1"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 64. 887-890 (2000)
[Publications] N.Lu et al.: "Crystallization and Initial X-ray analysis of Alkaline Xylanase"Acta Cryst.. D56. 464-465 (2000)
[Publications] T.Dake et al.: "Microbial Degradation of Disodium Terephthalate by Alkaliphilic Dietzia sp. Strain GS-1"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 64. 2709-2711 (2000)
[Publications] R.Yatsunami et al.: "The Gene Encoding a Novel halorhodopsin-like Protein of Extremely Halophilic Archaeon Haloarcula japonica Strain TR-1"Nucleic Acids Symp.Ser.. 44. 1-2 (2000)
[Publications] 中村聡ほか(共著): "極限環境微生物とその利用"講談社サイエンティフィク. 150 (2000)
[Publications] 中村聡ほか(分担): "バイオ機器分析入門(相澤益男,山田秀徳・編)"講談社サイエンティフィク. 200 (2000)

2000 Fiscal Year Annual Research Report

高度好塩性古細菌の光駆動型エネルギー獲得系の人工アーキテクチャー

Principal Investigator

中村 聡 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50227899)

Research Products

[Publications] R.Yatsunami et al.: "A Novel Bacteriohodopsin-like Protein from Haloarcula japonica Strain TR-1 : Gene Cloning, Sequencing and Transcription Analysis"Extremophiles. 4. 109-114 (2000)

[Publications] D.Sugimori et al.: "Purification and Characterization of a Ferredoxin from Haloarcula japonica Strain TR-1"BioMetals. 13. 13-28 (2000)

[Publications] H.Takahashi et al.: "Purification and Some Properties of a Basic Xylanase Produced by Thermoalkaliphilic Bacillus sp. Strain TAR-1"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 64. 887-890 (2000)

[Publications] N.Lu et al.: "Crystallization and Initial X-ray analysis of Alkaline Xylanase"Acta Cryst.. D56. 464-465 (2000)

[Publications] T.Dake et al.: "Microbial Degradation of Disodium Terephthalate by Alkaliphilic Dietzia sp. Strain GS-1"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 64. 2709-2711 (2000)

[Publications] R.Yatsunami et al.: "The Gene Encoding a Novel halorhodopsin-like Protein of Extremely Halophilic Archaeon Haloarcula japonica Strain TR-1"Nucleic Acids Symp.Ser.. 44. 1-2 (2000)

[Publications] 中村聡 ほか(共著): "極限環境微生物とその利用"講談社サイエンティフィク. 150 (2000)

[Publications] 中村聡 ほか(分担): "バイオ機器分析入門(相澤益男,山田秀徳・編)"講談社サイエンティフィク. 200 (2000)

中村聡東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50227899)

[Publications] 中村聡ほか(共著): "極限環境微生物とその利用"講談社サイエンティフィク. 150 (2000)

[Publications] 中村聡ほか(分担): "バイオ機器分析入門(相澤益男,山田秀徳・編)"講談社サイエンティフィク. 200 (2000)