2001 Fiscal Year Annual Research Report

脊椎動物モデルとしての小型魚類の発生の遺伝子システムの解明

Research Project

Project/Area Number	12202004
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	武田洋幸東京大学, 大学院・理学系研究科, 教授 (80179647)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	堀寛名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (60116663)
Keywords	メダカ / EST / Hox / 器官形成 / BAC / ゲノム
Research Abstract	本研究の目的は,小型魚類メダカを用いてその発生過程に働く遺伝子システムを発現遺伝子(武田)とゲノム構造(堀)の両面から解析し,脊椎動物の発生の進化過程を明らかにすることである.本年度は以下の研究成果が得られた。 (1)メダカ体節期胚(南日本系統の純系Hd-rR)のcDNAライブラリーから,クローンをランダムにピックアップして3'と5'両側から配列を決定した。現在、約14,000弱のクローンの解析が完了し,クラスター数約5,400を得ている。また,多検体の自動化in situ hybridization法を確立して,1,000クラスターについて初期胚での発現パターンを記録した。約35%が組織特異的発現を示すクローンであった。現在,論文を準備中である。また,得られた配列情報をDDBJへ平成14年1月に登録して、メダカホームページMbase上でも公開した。 (2)メダカゲノムの基盤整備を進めるために,これまでに単離された発現遺伝子をメダカの連鎖地図へマッピングするシステムを導入した。現在,1ヶ月に30個のクローンを染色体上にマップする体制を整えた(精度2.5cM)。これまでに約150個のESTのマッピングを完了した。 (3)メダカhox遺伝子hoxcaクラスターを持つBACクロ-ンについてショットガン法による配列決定をおこない、240Kbのcloneのほぼその全体像をえることができた。さらにゲノムの全体像の解析がフグゲノムにおいて、不完全ながらも進行しはじめており、この膨大な情報をメダカの遺伝子地図と連結し、比較ゲノム的にメダカゲノムを明らかにする研究を開始した。さらに我々の構築したメダカHd-rR BACライブラリーの維持、分配、メダカ連鎖群1のBACコンテイグマップ作りを行ない、約3分の1の地図を作成した。

Research Products
(12 results)

All Other

All Publications (12 results)

[Publications] Takuya Sakaguchi: "Expression of Zebrafish btg-b, an anti-proliferative cofactor, during early enbryogenesis"Mechanisms of Development. 104. 113-115 (2001)
[Publications] Takuya Sakaguchi: "A novel sox gene, 226D7, acts downstream of Nodal signaling to specify endoderm precursors in zebrafish"Mechanism of Development. 107. 25-38 (2001)
[Publications] Minori Shinya: "Fgf signalling through MAPK cascade is required for development of the subpallial telencephalon in zebrafish embryos"Development. 128. 4153-4154 (2001)
[Publications] Atsushi Sawada: "Fgf/YMAPK signalling is a crucial positional cue in somite boundary formation"Development. 128. 4873-4880 (2001)
[Publications] Yumiko Saga: "The making of the somite : molecular events in vertebrate segmentation"Nature Reviews Genetics. 2. 835-845 (2001)
[Publications] Sumito Koshida: "Inhibition of BMP activity by the FGF signal promotes posterior neural development in zebrafish"Developmental Biology. (in press). (2002)
[Publications] 成瀬清: "ゲノム時代を泳ぎ抜く -小型魚類"細胞工学. 22. 56-62 (2002)
[Publications] Masaru Matsuda: "Construction of a BAC library derived from the inbred Hd-rR strain of the teleost fish, Oryzias latipes"Genes Genetic System. 76(1). 61-63 (2001)
[Publications] Akihiko Koga: "The Tol2 transposable element of the medaka fish : an active DNA-based element naturally occurring in a vertebrate genome. (Review)"Genes Genetic System. 76(1). 1-8 (2001)
[Publications] Akihiko Koga: "Transpozable element in medaka fish. (Review)"Zoological Science. 19(1). 1-6 (2002)
[Publications] Akihiko Koga: "Gene transfer and cloning of flanking chromosomal regions using medaka fish Tol2 transposable element"Marine Biotechnology. 4(in press). (2002)
[Publications] 武田洋幸: "動物のからだづくり -形態発生の分子メカニズム-"朝倉書店. 138 (2001)

2001 Fiscal Year Annual Research Report

脊椎動物モデルとしての小型魚類の発生の遺伝子システムの解明

Principal Investigator

武田 洋幸 東京大学, 大学院・理学系研究科, 教授 (80179647)

Research Products

[Publications] Takuya Sakaguchi: "Expression of Zebrafish btg-b, an anti-proliferative cofactor, during early enbryogenesis"Mechanisms of Development. 104. 113-115 (2001)

[Publications] Takuya Sakaguchi: "A novel sox gene, 226D7, acts downstream of Nodal signaling to specify endoderm precursors in zebrafish"Mechanism of Development. 107. 25-38 (2001)

[Publications] Minori Shinya: "Fgf signalling through MAPK cascade is required for development of the subpallial telencephalon in zebrafish embryos"Development. 128. 4153-4154 (2001)

[Publications] Atsushi Sawada: "Fgf/YMAPK signalling is a crucial positional cue in somite boundary formation"Development. 128. 4873-4880 (2001)

[Publications] Yumiko Saga: "The making of the somite : molecular events in vertebrate segmentation"Nature Reviews Genetics. 2. 835-845 (2001)

[Publications] Sumito Koshida: "Inhibition of BMP activity by the FGF signal promotes posterior neural development in zebrafish"Developmental Biology. (in press). (2002)

[Publications] 成瀬 清: "ゲノム時代を泳ぎ抜く -小型魚類"細胞工学. 22. 56-62 (2002)

[Publications] Masaru Matsuda: "Construction of a BAC library derived from the inbred Hd-rR strain of the teleost fish, Oryzias latipes"Genes Genetic System. 76(1). 61-63 (2001)

[Publications] Akihiko Koga: "The Tol2 transposable element of the medaka fish : an active DNA-based element naturally occurring in a vertebrate genome. (Review)"Genes Genetic System. 76(1). 1-8 (2001)

[Publications] Akihiko Koga: "Transpozable element in medaka fish. (Review)"Zoological Science. 19(1). 1-6 (2002)

[Publications] Akihiko Koga: "Gene transfer and cloning of flanking chromosomal regions using medaka fish Tol2 transposable element"Marine Biotechnology. 4(in press). (2002)

[Publications] 武田 洋幸: "動物のからだづくり -形態発生の分子メカニズム-"朝倉書店. 138 (2001)

武田洋幸東京大学, 大学院・理学系研究科, 教授 (80179647)

[Publications] 成瀬清: "ゲノム時代を泳ぎ抜く -小型魚類"細胞工学. 22. 56-62 (2002)

[Publications] 武田洋幸: "動物のからだづくり -形態発生の分子メカニズム-"朝倉書店. 138 (2001)