2003 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
12212002
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Research Institution | Research Institute, International Medical Center of Japan |
Principal Investigator |
笹月 健彦 国立国際医療センター, 研究所, 所長 (50014121)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
猪子 英俊 東海大学, 医学部, 教授 (10101932)
佐々木 泰史 札幌医科大学, 医学部, 助手 (70322328)
有村 佳昭 札幌医科大学, 医学部, 助手 (80305218)
山本 健 九州大学, 生体防御医学研究所, 助教授 (60274528)
横田 淳 国立がんセンター, 研究所, 部長 (10191503)
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Keywords | 胃がん / ゲノム / 罹患同胞対 / 連鎖 / 相関 / マイクロサテライト / SNP |
Research Abstract |
胃がんは、罹患率・死亡率の減少を認めるものの、未だ死亡の主要原因疾患である。胃がん発症には複数の遺伝要因と環境要因が関与するが、疫学研究によりどのような環境要因がリスクとなるかを解析する一方で、胃がん発症の遺伝要因を同定し、遺伝的多型と疫学リスクとの関連や、得られた遺伝子の機能解析によって胃がん発症の分子メカニズムを解明することは、新しい検査法・診療法を開発するための基盤を築くことに繋がり有意義である。 本研究では、胃がんの発症感受性を規定する遺伝要因の解明を目的として、1)罹患同胞対法による全ゲノム連鎖解析、2)マイクロサテライトマーカーを用いた全ゲノム相関解析、3)SNPを用いた候補遺伝子解析、を進めている。これまでの118組の罹患同胞対解析結果を確認するために、新たに胃がん試料収集委員会にて収集された52組を加え、170組を対象とした全ゲノムスキャンを実施した。その結果、これまで得られた染色体領域1p32、2q33、11p14、21q21にLOD値が1.3から1.7を示す連鎖領域を見出した。罹患同胞を性別、年齢、発症部位、組織型などに分類し再解析したところ、近位部に腫瘍を発症した患者を含む同胞群において、2q33がLOD値3.6を示した。この染色体領域に新たにマイクロサテライトマーカーを加え解析を行い連鎖を確認した。また、全ゲノム相関解析を2次スクリーニングまで終了し、317個の陽性マーカーを得、これらについて3次スクリーニングを進行させている。さらに、SNPを用いた相関解析を、これまで胃がんとの相関あるいは腫瘍部での発現変化が報告されている候補遺伝子21遺伝子を対象として実施し、女性罹患者に特異的に相関を示す一群のSNPをATM遺伝子領域内に同定した(対立遺伝子頻度による検定:p=0.0096、OR=1.45、遺伝子型による検定:p=0.0003、OR=2.26)。
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[Publications] Qi X et al.: "p38 MAPK activation selectively induces cell death in K-ras mutated human colon cancer cells through regulation of vitamin D receptor."J.Biol.Chem.. (in press). (2004)
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[Publications] Kunisaki Y, et al.: "Defective fetal liver erythropoiesis and T-lymphopoiesis in mice lacking phosphatidylserine receptor."Blood. (in press). (2004)
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[Publications] Yamamoto K, et al.: "Polycomb group suppressor of zeste 12 links heterochromatin protein 1 alpha and enhances of zeste 2"J.Biol.Chem.. 279. 401-406 (2004)
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[Publications] Klampfer L, et al.: "Inhibition of interferon gamma signaling by the short chain fatty acid butyrate"Mol.Cancer Res.. 1. 855-862 (2003)
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[Publications] Klampfer L, et al.: "Oncogenic Ki-ras inhibits the expression of interferon-responsive genes through inhibition of STAT1 and STAT2 expression."J.Biol.Chem.. 278. 46278-46287 (2003)
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[Publications] Sanui T, et al.: "DOCK2 is essential for antigen-induced translocation of TCR and lipid rafts, but not PKC-theta and LFA-1, in T cells."Immunity. 19. 119-129 (2003)