2003 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝的発がん高リスクグループの遺伝的素因に関する研究

Research Project

Project/Area Number	12213084
Research Institution	Okayama University
Principal Investigator	清水憲二岡山大学, 大学院・医歯学総合研究科, 教授 (10037286)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	堺明子岡山大学, 大学院・医歯学総合研究科, 助手 (60205698) 松原長秀岡山大学, 医学部・歯学部附属病院, 助手 (70314672) 大内田守岡山大学, 大学院・医歯学総合研究科, 助教授 (80213635) 伊藤佐智夫岡山大学, 大学院・医歯学総合研究科, 助手 (30335624)
Keywords	発がん高リスク遺伝子 / がん体質遺伝 / 遺伝的多型 / ミスセンス1塩基多型 / ms-SNP / DNA修復遺伝子 / オッズ比
Research Abstract	本研究ではいわゆる「がん体質遺伝」の実体を追究するために、がん関連候補遺伝子のミスセンス1塩基多型(ms-SNP)を広汎に検索している。これまでに計80遺伝子で117箇所のms-SNP候補を特定し、今年度は計29遺伝子の候補ms-SNPについて210例の健常人検体及び166例のインフォームドコンセントを得たがん患者のDNAを用いてそれらのアレル分布を解析した。方法としては、各検体のDNAから目的のエクソンを含む領域をPCR増幅し、SNP部位の塩基置換をRFLP法またはその変法等を用いて検出した。本年度は発がんのリスクと連関する3種の新しいms-SNPを発見することができた。従って、前年度までの結果と合わせ、統計学的に有意な新しいリスク関連ms-SNPを計10種同定したことになる(特許出願準備中)。既知のp53第72コドンのms-SNPを含めたこれら11種は、肺がんと頭頸部がんでは高リスクSNPが8種(オッズ比;1.91〜18)と保護的SNPが3種(オッズ比;0.18〜0.49)で、DNAの修復/複製(6種)、がん抑制(3種)及び染色体分配(2種)に関与する遺伝子群であった。興味深いことに、これらの多くは高リスク遺伝子型ががんの種類によって異なっていた。個々の検体毎にこれらのms-SNPの重複(累積オッズ比)を検討した結果、肺腺がんの高リスク遺伝子型が2種以上重複し、かつ保護的SNPを持たないために累積オッズ比が5.8以上を示す人は、健常人では約5%であったが、肺腺がん患者では約30%に達した(P=0.000021)。この範疇に入る人は本邦で約700万人存在すると推計される。このように、本研究で明らかになった発がんの高リスクms-SNPは、確かに実際の発がんリスクの遺伝的背景となっていることが強く示唆された。以上の結果は特許出願準備中なので、遺伝子名等については割愛した。

Research Products
(11 results)

All Other

All Publications (11 results)

[Publications] Toyooka, S., ほか: "Smoke exposure, histologic type and geography-related differences in the methylation profiles of non-small cell lung cancer"Int.J.Cancer. 103. 153-160 (2003)
[Publications] Beder, LB., ほか: "Genome-wide analyses on loss of heterozygosity in head and neck squamous cell carcinomas"Lab.Invest. 99. 99-105 (2003)
[Publications] Uenaka, A., ほか: "Cryptic CTL epitope on a murine sarcoma Meth A generated by exon extension as a novel mechanism"J.Immun. 170. 4862-4868 (2003)
[Publications] Toyooka, S., ほか: "Detection of codon 61 point mutations of the K-ras gene in lung and colorectal cancers by enriched PCR"Oncology Rep. 10. 1455-1459 (2003)
[Publications] Morimoto, Y., ほか: "Splicing isoform of SYT-SSX fusion protein accelerates transcriptional activity and cell proliferation"Cancer Letters. 199. 35-43 (2003)
[Publications] Ohtsuka, Y., ほか: "Paroxysmal movement disorders in severe myoclonic epilepsy in infancy"Brain & Development. 25. 401-405 (2003)
[Publications] Nagasaka, T., ほか: "Hypermethylation of O_6-methylguanine-DNA methyltransferase promoter may predict nonrecurrence after chemotherapy in colorectal cancer cases"Clin.Cancer Res. 9. 5306-5312 (2003)
[Publications] Koyama, M., ほか: "Activated proliferation of B-cell lymphomas/leukemias with the SHP1 gene silencing by aberrant CpG methylation"Lab.Invest. 83. 1849-1858 (2003)
[Publications] Morimoto, Y., ほか: "Single nucleotide polymorphism in fibroblast growth factor receptor 4 at codon 388 is associated with prognosis in high-grade soft tissue sarcoma"Cancer. 98. 2245-2250 (2003)
[Publications] Kawai, A., ほか: "Establishment and characterization of a biphasic synovial sarcoma cell line, SYO-1"Cancer Letters. 204. 105-113 (2004)
[Publications] Kambara, T., ほか: "Allelic loss of a common microsatellite marker Myc L1 : a useful prognostic factor of poor outcomes in colorectal cancer"Clin.Cancer Res. (印刷中). (2004)

2003 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝的発がん高リスクグループの遺伝的素因に関する研究

Principal Investigator

清水 憲二 岡山大学, 大学院・医歯学総合研究科, 教授 (10037286)

Research Products

[Publications] Toyooka, S., ほか: "Smoke exposure, histologic type and geography-related differences in the methylation profiles of non-small cell lung cancer"Int.J.Cancer. 103. 153-160 (2003)

[Publications] Beder, LB., ほか: "Genome-wide analyses on loss of heterozygosity in head and neck squamous cell carcinomas"Lab.Invest. 99. 99-105 (2003)

[Publications] Uenaka, A., ほか: "Cryptic CTL epitope on a murine sarcoma Meth A generated by exon extension as a novel mechanism"J.Immun. 170. 4862-4868 (2003)

[Publications] Toyooka, S., ほか: "Detection of codon 61 point mutations of the K-ras gene in lung and colorectal cancers by enriched PCR"Oncology Rep. 10. 1455-1459 (2003)

[Publications] Morimoto, Y., ほか: "Splicing isoform of SYT-SSX fusion protein accelerates transcriptional activity and cell proliferation"Cancer Letters. 199. 35-43 (2003)

[Publications] Ohtsuka, Y., ほか: "Paroxysmal movement disorders in severe myoclonic epilepsy in infancy"Brain & Development. 25. 401-405 (2003)

[Publications] Nagasaka, T., ほか: "Hypermethylation of O_6-methylguanine-DNA methyltransferase promoter may predict nonrecurrence after chemotherapy in colorectal cancer cases"Clin.Cancer Res. 9. 5306-5312 (2003)

[Publications] Koyama, M., ほか: "Activated proliferation of B-cell lymphomas/leukemias with the SHP1 gene silencing by aberrant CpG methylation"Lab.Invest. 83. 1849-1858 (2003)

[Publications] Morimoto, Y., ほか: "Single nucleotide polymorphism in fibroblast growth factor receptor 4 at codon 388 is associated with prognosis in high-grade soft tissue sarcoma"Cancer. 98. 2245-2250 (2003)

[Publications] Kawai, A., ほか: "Establishment and characterization of a biphasic synovial sarcoma cell line, SYO-1"Cancer Letters. 204. 105-113 (2004)

[Publications] Kambara, T., ほか: "Allelic loss of a common microsatellite marker Myc L1 : a useful prognostic factor of poor outcomes in colorectal cancer"Clin.Cancer Res. (印刷中). (2004)

清水憲二岡山大学, 大学院・医歯学総合研究科, 教授 (10037286)