2003 Fiscal Year Annual Research Report
転座関連遺伝子及び転写因子による細胞分化とがん化の分子機構
Project/Area Number |
12215167
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Research Institution | Aichi Cancer Center Research Institute |
Principal Investigator |
瀬戸 加大 愛知県がんセンター, 遺伝子医療研究部, 部長 (80154665)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
森下 和広 宮崎医科大学, 医学部, 教授 (80260321)
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Keywords | 癌 / ゲノム / 悪性リンパ腫 / マイクロアレー / トランスレーショナルリサーチ |
Research Abstract |
びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)は複数の疾患単位を含むが、BCL6転座を含んで、明確なマーカーが見出せなかった。我々は、細胞表面マーカーCD5に着目し、CD5+DLBCLが予後不良群を形成することを明らかにし、報告してきた。しかし、そのゲノム異常については明らかではなく、CD5+DLBCLについての分子基盤を明らかにすることが、重要な課題であった。CGH法を用いて検討した結果、多くの共通するゲノム変化が認められたが、CD5+DLBCL、CD5-DLBCLそれぞれに特徴的なゲノム変化領域を見出した(Karnan et al., Genes Chrom.Cancer, in press)。当初の疑問としての分子基盤を明らかにするという目的は十分達成された。しかし、CGH法は10Mb以下の遺伝子変化を見出すことができないために、今後はArray CGHによる解析に切り変えていく必要がある。Array CGHグラスの作成は改良を重ね、現在Version3.0となって使用している。検体を用いた検討では、再現性の高い結果が得られている。検体数が10例以上あると、2300個程度のBACクローンで十分な情報が得られることも明らかとり、報告した。改良すべき点は、現在使用している2300個クローンの10%程度が、弱いシグナルのため不安定な値を示すことである。この点については、近傍の新たなBACクローンを検討し、改良型のVersion4.0を作成しつつある。
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Research Products
(11 results)
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[Publications] Nomura, K: "Detection of t(11;18)(q21;q21) in marginal zone lymphoma of mucosa-associated lymphocytic tissue type on paraffin-embedded tissue sections by using fluorescence in situ hybridization."Cancer Genet Cytogenet. 140. 49-54 (2003)
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[Publications] Ando, T: "Multiple fuzzy neural network system for outcome prediction and classification of 220 lymphoma patients on the basis of molecular profiling."Cancer Sci. 94. 906-913 (2003)
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[Publications] Sivasundram, K: "Mutational analysis of the ST7 gene in human myeloid tumor cell lines."Oncology Reports. 10. 1737-1739 (2003)
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[Publications] Izumiyama, K: "Stability and subcellular localization of API2-MALT1 chimeric protein involved in t(11;18)(q21;q21) MALT lymphoma."Oncogene. 22. 8085-8092 (2003)
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[Publications] Nakamura, T: "Gastric low-grade B-cell MALT lymphoma : treatment, response, and genetic alteration."J Gastroenterol. 38. 921-929 (2003)
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[Publications] Suguro-Katayama: "Heterogeneous copy numbers of API2-MALT1 chimeric transcripts in mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma."Leukemia. 17. 2508-2512 (2003)
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[Publications] Karnan, S: "Analysis of Chromosomal Imbalances in de novo CD5-Positive Diffuse Large B-Cell Lymphoma Detected by Comparative Genomic Hybridization."Genes Chromosomes Cancer. 39. 77-81 (2004)
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[Publications] Matsuo, K: "Lack Of association between DNA base excision repair gene XRCC1 Gln399Arg polymorphism and risk of malignant lymphoma in Japan."Cancer Genetics and Cytogenetics. 149. 77-80 (2004)
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[Publications] Tagawa, H: "MASL1, a candidate oncogene found in amplification at 8p23.1, is translocated in immunoblastic B-cell lymphoma cell line OCI-LY8."Oncogene. (in press).
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[Publications] Hosokawa, Y: "Anti-apoptotic function of API2-MALT1 fusion protein involved in t(11;14)(q21;q21) MALT lymphoma."Cancer Res. (in press).
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[Publications] Ota, A: "Identification and Characterization of A Novel Gene, C13orf25, as A Target for 13q31-q32 Amplification in Malignant Lymphoma."Cancer res. (in press).