がんの新規ゲノム異常の探索と多項目遺伝情報に基づくがんの個性診断法の開発

2000 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 12217045
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• Research Institution: Tokyo Medical and Dental University
• Principal Investigator: 稲澤 譲治 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 井本 逸勢 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助手 (30258610)
• Keywords: 腫瘍 / ゲノム異常 / 遺伝子増幅 / 癌関連遺伝 / 遺伝子診断 / マイクロアイレ / 個性診断

Research Abstract

がん細胞は複数の遺伝子が多段階的に変異を起こし蓄積することで転移や治療抵抗性などの悪性形質を獲得する。この悪性形質は同じ病型でも個々の患者でしばしば異なり、今後「がんの個性」を見極めた至適治療の選択が重要課題になる。既にがん悪性化に関与する遺伝子も知られているが未だ一部に過ぎず、複雑で多様な「がんの個性」を規定する未知遺伝子群の徹底的な解明とそのがん診断への応用に期待がかかる。今回の研究では、各種腫瘍においてゲノムコピー数異常の網羅的解析を行い、検出した新規の遺伝子増幅領域を標的に位置候補遺伝子アプローチで癌関連遺伝子の単離を進めた。また、CGH法を基盤にした高密度、高精度のゲノムマイクロアレイの開発に着手しhigh-throughput遺伝子診断技術の開発基盤を構築し、「がんの個性診断法」の確立を進め以下の成果を得た。
(1)種々の癌腫において腫瘍細胞株ならびに臨床サンプルの合計300例以上を対象にCGH法によりゲノムコピー数異常を探索した。
(2)見出された新規増幅領域のうち1q32,3q26-27,5p11.2,5p13,9p24,11p13,14q12-13,15q26,18p13,20qなどの領域で癌関連遺伝子の探索を進め、ATF3,CENPF(1q32)、SNO,EVI1(3q26)、CD44(11p13)、IQGAP1(15q26)、TS,YES1,TGIF(18p)の既知遺伝子が増幅の標的であることを明らかにした。また、新規の癌関連遺伝子候補として9p23-24増幅領域よりGASC1、20q増幅領域よりTGIF2を単離した。
(3)高密度ゲノムDNAアレイの作製に着手し、UCSF癌研究所Joe Gray博士らと共同によりゲノムアレイにより1コピーレベルの異常が検出できることを確認した。

Research Products

• [Publications] Yang Z-Q,Inazawa J. et al.: "A novel amplicon haboring NFIB proximal to GASC1 at 9p23-24 in squamous cell carcinoma of the esophagus."Jpn J Cancer Res. (in press). (2001)
• [Publications] Watanabe T,\ Inazawa J. et al.: "A Novel Amplification at 17q21-23 in Ovarian Cancer Cell Lines Detected by Comparative Genomic Hybridization."Gynecol Oncol. (in press). (2001)
• [Publications] Pimkhaokham A,Inazawa J. et al.: "Nonrandom Chromosomal Imbalances in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Cell Lines : Possible Involvement of the ATF3 and CENPF Genes in the 1q32 Amplicon."Jpn J Cancer Res. 91. 1126-1133 (2000)
• [Publications] Fukuda Y,Inazawa J. et al: "CD44 is a potential target of amplification within the 11p13 amplicon detected in gastric-cancer cell lines."Genes Chromosomes Cancer. 29. 315-324 (2000)
• [Publications] Yang Z-Q,Inazawa J. et al.: "Identification of a Novel Gene, GASC1, within an Amplicon at 9p23-24 Frequently Detected in Esophageal Cancer Cell Lines."Cancer Res. 60. 4735-4739 (2000)
• [Publications] Yang Z-Q,Inazawa J. et al.: "Molecular cytogenetic analysis of 17 renal-cancer cell lines : increased copy number at 5q31-33 in cell lines from nonpapillary carcinomnas."Jpn J Cancer Res. 91. 156-163 (2000)
• [Publications] 稲澤譲治: "新女性医学大系第28巻・遺伝の基礎と臨床"中山書店. 461 (2000)