2003 Fiscal Year Annual Research Report

がんの新規ゲノム異常の探索と多項目遺伝情報によるがんの個性診断法の開発

Research Project

Project/Area Number	12217045
Research Institution	Tokyo Medical and Dental University
Principal Investigator	稲澤譲治東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)
Keywords	がん / 微細ゲノム構造異常 / がん遺伝子 / 遺伝子増幅 / がん抑制遺伝子 / CGHアレイ / 網羅的 / メチル化
Research Abstract	ポストシーケンスの癌研究において、基礎研究で得られた成果を基盤に実地臨床への応用が可能となる新しい診断、治療、予防法の開発に多大な期待が寄せられている.今回の研究では、各種の癌細胞において、網羅的ゲノム一次構造異常解析、エピジェネテイク遺伝子制御機構、体系的遺伝子発現などの統合的な癌ゲノム解析を推進し、癌の個別化医療の実現に資する成果を目的に研究を行った.その結果、(1)900例以上の癌をCGH解析し、この結果をデータベース化して"CGH database"として公開した(http://www.c ghtmd.jp/cghdatabase/index.html).(2)多くの新規増幅領域を発見し、その標的癌関連遺伝子を同定した.中でも食道扁平上皮癌(ESC)の高頻度3q27増幅領域より新規癌遺伝子ZASC1を同定し、悪性度診断のバイオマーカーとして、さらに分子標的治療のターゲットとしての可能性を示した.(Imoto I et al.,Cancer Research 2003)また、ESCのCGHアレイ解析により,高頻度ホモ欠失領域を発見し、ESCの癌抑制遺伝子候補MCG7(lab.name)を同定した.ESC臨床サンプルの40%でホモ欠失を確認し、ホモ欠失例陰性例におけるMCG7発現消失がDNAメチル化によることを確認し、ESC癌抑制遺伝子の可能性を示した.(3)1コピーのヘミ欠失を正確に検出する高密度、高精度CGHアレイシステムを開発し、実用化した.(4)CGHアレイにより、多くの新しいホモ欠失領域と癌抑制遺伝子候補を見出した.(5)MCA法をゲノムアレイに応用し、メチル化DNAの網羅的探索法を確立した.

Research Products
(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] Yasui K, Inazawa J et al.: "Alteration in Copy-Numbers of Genes as a Mechanism for Acquired Drug Resistance"Cancer Research. 64. 1403-1410 (2004)
[Publications] Hirasawa A, Inazawa J et al.: "Relationship between Prognostic Factors and the Biological Mechanisms Accounting for Genetic Instability in Endometrial Adenocarcinoma of the Uterus"Clinical Cancer Research. 15. 5675-5682 (2003)
[Publications] Okamoto H, Inazawa J et al.: "PTK2 and EIF3S3 Genes May be Amplification Targets at 8q23-q24 and Are Associated with Large Hepatocellular Carcin"Hepatology. 38. 1242-1249 (2003)
[Publications] Imoto I, Inazawa J et al.: "Identification of ZASC1 Encoding a Kruppel-like Zinc Finger Protein as a Novel Target for 3q26 Amplification in Esophageal Squamous Cell Carcinomas"Cancer Research. 63. 5691-5696 (2003)
[Publications] Yokoi S, Inazawa J et al.: "TERC Identified as a probable target within the 3q26 amplicon that is detected frequently in non-small cell lung cancers"Clinical Cancer Research. 15. 4705-1713 (2003)
[Publications] Hirasawa A, Inazawa J et al.: "Association of 17q21-q24 Gain in Ovarian Clear Cell Adenocarcinomas with Poor Prognosis and Identification of PPM1D and APPBP2 as Likely Amplification Targets"Clinical Cancer Research. 9. 1995-2004 (2003)
[Publications] 稲澤譲治: "生命科学"東京化学同人. 228 (2004)

2003 Fiscal Year Annual Research Report

がんの新規ゲノム異常の探索と多項目遺伝情報によるがんの個性診断法の開発

Principal Investigator

稲澤 譲治 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)

Research Products

[Publications] Yasui K, Inazawa J et al.: "Alteration in Copy-Numbers of Genes as a Mechanism for Acquired Drug Resistance"Cancer Research. 64. 1403-1410 (2004)

[Publications] Hirasawa A, Inazawa J et al.: "Relationship between Prognostic Factors and the Biological Mechanisms Accounting for Genetic Instability in Endometrial Adenocarcinoma of the Uterus"Clinical Cancer Research. 15. 5675-5682 (2003)

[Publications] Okamoto H, Inazawa J et al.: "PTK2 and EIF3S3 Genes May be Amplification Targets at 8q23-q24 and Are Associated with Large Hepatocellular Carcin"Hepatology. 38. 1242-1249 (2003)

[Publications] Imoto I, Inazawa J et al.: "Identification of ZASC1 Encoding a Kruppel-like Zinc Finger Protein as a Novel Target for 3q26 Amplification in Esophageal Squamous Cell Carcinomas"Cancer Research. 63. 5691-5696 (2003)

[Publications] Yokoi S, Inazawa J et al.: "TERC Identified as a probable target within the 3q26 amplicon that is detected frequently in non-small cell lung cancers"Clinical Cancer Research. 15. 4705-1713 (2003)

[Publications] Hirasawa A, Inazawa J et al.: "Association of 17q21-q24 Gain in Ovarian Clear Cell Adenocarcinomas with Poor Prognosis and Identification of PPM1D and APPBP2 as Likely Amplification Targets"Clinical Cancer Research. 9. 1995-2004 (2003)

[Publications] 稲澤譲治: "生命科学"東京化学同人. 228 (2004)

稲澤譲治東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)