2000 Fiscal Year Annual Research Report
体系的遺伝子異常解析に基づく乳癌・甲状腺癌の遺伝子診断法の開発
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12217141
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Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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| Research Institution | Nippon Medical School |
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Principal Investigator |
江見 充 日本医科大学, 老人病研究所, 教授 (90221118)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
霞 富士雄 癌研究会附属病院, 外科, 部長 (40085593)
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| Keywords | 乳癌 / 甲状腺癌 / 遺伝子診断 / マイクロアレイ / 技術移転 / がん関連遺伝子 / 染色体欠失 / 予後因子 |
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| Research Abstract |
1.「新規がん関連遺伝子の同定」1-cM以内に原因遺伝子の存在位置を限局化したのち、ショットガンシークエンシングを行うとともに、同領域のESTを用いて、cDNA発現プロファイル解析を行い、がん関連遺伝子をクローニングした。17q25.1領域からDMC1,UBE2,DMHC,SRP68,4q21領域からJNK3など、種々のヒトがんにて発現消失を示す新規遺伝子をクローニングし、甲状腺癌におけるELKS融合遺伝子を同定した。
2.「乳癌・甲状腺癌の遺伝子診断の開発と技術移転」乳癌および甲状腺癌の多形性DNAマーカーを用いた解析から癌の悪性度、再発、生命予後に関わる遺伝的変化の特定と臨床応用を進めた。乳癌手術5年間の追跡調査と遺伝子解析により、no乳癌、n1・2乳癌において術後予知因子となる染色体欠失を同定した。これらの結果を踏まえて、平成12年夏より、研附属病院および長野県下の主幹病院と連携し、毎週約12症例(年間600症例)の乳癌の遺伝子診断を実施し、臨床サイドへ遺伝子診断の結果を報告し、遺伝子診断による症例の層別化と高危険群の予測法を検討し、基礎研究から臨床実地への技術移転を試みている。
3.「体系的遺伝子発現解析」cDNAマイクロアレイ解析実験の条件検討を詳細に行うため、T7RNAポリメラーゼによるRNA増幅を種々の条件にて行い、2回のRNA増幅で約100倍のポリ(A)RNAの得られる条件を設定した。約1万種類のcDNAを高密度にスポットしたマイクロアレイ・スライドグラス上でハイブリダイゼーションを行った。スキャニング・データのコンピュータ解析を行い、約1万種の遺伝子の癌組織における発現プロファイル解析を行うことが可能となった。
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[Publications] Ito,K.,Emi,M. et al.: "Association of Allelic Loss on 1q, 4p, 7q, 9p, 9q, and 16q with Postoperative Death in Papillary Thyroid Carcinoma."Clin.Cancer Res.. 6. 1819-1825 (2000)
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[Publications] Utada,Y.,Emi,M. et al.: "Allelic Loss at 1p34-36 Predicts Poor Prognosis in Node-negative Breast Cancer."Clin.Cancer Res.. 6. 3193-3198 (2000)
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[Publications] Nakamura,Y.,Emi,M. et al.: "Loss of heterozygosity at 3p24-p25 as a prognostic factor in breast cancer."Cancer Lett.. 152. 63-69 (2000)
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[Publications] Moriyama,Y.,Emi,M. et al.: "New Target Region of Allelic Loss in Hepatocellular Carcinomas within a l-cM Interval on Chromosome 6q23."J.Hepatol. 32. 85-90 (2000)
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[Publications] Inazawa,J.,Emi,M. et al.: "Genomic structure and chromosomal mapping of the human Site-1 protease (S1P) gene."J.Hum.Genet.. 45. 212-217 (2000)
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[Publications] Kodama,T.,Emi,M. et al.: "Genomic structure of the gene encoding human 3-hydroxy-3-methyl-glutaryl coenzyme A reductase : comparison of exon/intron organization of sterol-sensing domains amang four related genes."J.Hum.Genet.. 45. 284-289 (2000)
