2000 Fiscal Year Annual Research Report
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12306005
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
正木 春彦 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (50134515)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
日高 真誠 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (50183918)
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| Keywords | 大腸菌 / コリシン / バクテリオファージ / リボヌクレアーゼ / O157 / 酸塩基触媒 / tRNA / RNA制限酵素 |
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| Research Abstract |
1.新規のコリシンとファージの検索:国立感染研のコレクションより約2300株のO157株を選び、そのコリシンあるいはファージの生産性とそれらに対する感受性を調べた。全体の約24%の株が何らかのコリシンかファージを生産していた。このうち65%がコリシンDを、9%がコリシンIを、4%がE群コリシンを生産しており、現在のところ未同定のものが22%ある。当初期待したような、K12株を殺さずO157株を殺すようなコリシンは見つかっていない。またtRNAを標的とするコリシンE5とコリシンDのバリエーションを求めたが、コリシンE5の5株すべてと、コリシンDの任意の5株について活性ドメインとインヒビターに相当するプラスミド遺伝子領域をsequencingしたが、いずれも既知のものと同一構造を示した。またE群コリシンの中で、進化上の中間体と思われるようなプラスミドを2個、全配列を決定した。さらに、O157の70%に感染できるが、K12には感染できない新規のファージをO157株の中から見出し、現在構造を決定中である。べ口毒素遺伝子はコードしていない。
2.コリシンE5の酵素触媒機構:結晶構造解析データより、RNaseとしての触媒基として2個のLysと1個のArgが疑われた。様々な変異体の活性測定より、2個のLysが一般酸塩基触媒となっており、Argが反応中間体を鑑定化させているという、今までのヌクレアーゼにはない反応機構モデルを提出した。
3.コリシンDのRNaseドメインの特定:697アミノ酸残基からなるコリシンDの様々の長さのC末端側を、RNaseドメインを除いたコリシンE5と融合させ、キメラ体の殺菌活性を調べた。殺菌活性にはC末端の104アミノ酸ドメインでほぼ十分であることが判明した。またC末端160アミノ酸ドメインを精製し、これがtRNase活性を持っていることを確認した。
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Research Products
(4 results)
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[Publications] Tomita,K.: "A cytotoxic ribonuclease which specifically cleaves four isoaccepting arginine tRNAs at their anticodon loops."Proc.Natl.Acad.Sci.,USA.,. 97・15. 8278-8283 (2000)
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[Publications] 正木春彦: "バクテリオシンの多様性およびコリシンの構造と進化"蛋白質・核酸・酵素. 46・4. 305-314 (2001)
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[Publications] 小川哲弘: "tRNAを標的とする細胞毒性リボヌクレアーゼ"蛋白質・核酸・酵素. 46・4. 334-340 (2001)
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[Publications] 内山竹彦 他 編著: "生物間の攻撃と防御の蛋白質(蛋白質・核酸・酵素 2001年3月号増刊)"共立出版. 288 (2001)
