DNAマイクロアレイを応用した多項目遺伝子情報に基づく口腔癌の個性診断法の開発

2000 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 12357012
• Research Institution: Tokyo Medical and Dental University
• Principal Investigator: 天笠 光雄 東京医科歯科大学, 大学院・医歯学総合研究科, 教授 (00014332)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 久野 敦司 藤沢薬品工業株式会社, 医療関連事業部・技術センター, 次長(研究職) ; 稲澤 譲治 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)
• Keywords: 口腔癌 / ゲノム / DNA / 一次構造 / 癌関連遺伝子 / マイクロアレイ / CGH / FISH

Research Abstract

口腔外科領域の癌におけるゲノム変化を体系的・網羅的に検索し異常の検出された領域から癌関連遺伝子を単離・同定すると共に,新規に作製するゲノムDNAマイクロアレイを用いてこれらの異常と臨床病理学的データとの関連を体系的に解析することで,多項目遺伝情報に基づく口腔領域の「癌の個性診断法」を確立することを目的として研究を推進し,以下の成果を得た。
1.口腔,咽頭,食道領域の癌におけるゲノム異常の探索と検出された異常領域からの癌関連遺伝子異常を同定・単離するため,細胞株あるいは臨床検体よりDNA等の解析材料を抽出するとともに,臨床・病理学的データの収集を開始している。
2.これらの材料を対象にCGH法・FISH法にて解析することにより複数の新しい遺伝子増幅領域が検出された。これらの領域から,既知ならびに新規の増幅の標的となる癌関連遺伝子(例えば食道扁平上皮癌における1q32増幅領域内のATF3やCENPF,あるいは9p23増幅領域内のGASClやNF1Bなど)が単離でき,さらに他の領域でも解析を進めている。一部については遺伝子の機能解析も行っている。
3.網羅的かつ高精度にゲノムDNAコピー数の変化を検出するCGH法を基盤にした高密度・高感度のゲノムDNAマイクロアレイの開発に着手した。UCSF癌研究所Gray博士との共同研究により,既製のマイクロアレイを用いた方法より優れた,1コピーの変化をも検出できるシステムが実現可能であることを確認した。ゲノムワイドな遺伝子異常のスクリーニングに実用可能な高密度ゲノムDNAマイクロアレイの作製を進めている。

Research Products

• [Publications] Pimkhaokham A, et al.: "Non-random chromosomal imbalances in cell lines from esophageal squamous cell carcinomas : possible involvement of the ATF3 and CENPF genes in the lq32 amplicon."Japanese Journal of Cancer Research. 91・11. 1126-1133 (2000)
• [Publications] Sato M, et al.: "Genetically high susceptibility to oral squamous cell carcinoma in terms of combilined genotyping of CYP1A1 and GSTM1 genes."Oral Oncology. 36・3. 267-271 (2000)
• [Publications] Kurohara K, et al.: "Melton beta (ADAM19) gene : Cloning, mapping, and analysis of the regulatory region."Biochemical and Biophysical Research Communications. 270・2. 522-527 (2000)
• [Publications] Michi Y, et al.: "Human oral squamous cell carcinoma cell lines promote angiogenesis via expression of vascular endothelial growth factor and upregulation of KDR/flk-J expression in endothelial cells."Oral Oncology. 36・1. 81-88 (2000)
• [Publications] Mochida Y, et al.: "ASK1 inhibits Interleukin-1-Induced NF-kB activity through disruption of TRAF6-TAK1 interaction."The Journal of Biological Chemistry. 275・42. 32747-32752 (2000)
• [Publications] Mimura M, et al.: "Melanotic neuroectoderma tumor of infancy - Immunohistochemical and ultrastructural study-."The Asian Journal of Oral and Maxillfacial Surgery. 12・2. 217-224 (2000)
• [Publications] Yang Z-Q.et al.: "Identification of a novel gene, GASC1, within an amplicon at 9p23-24 frequently detected in esophageal-cancer cell lines."Cancer Research. 60・17. 4735-4739 (2000)
• [Publications] Fukuda Y.et al.: "CD44 is a potential target of amplification within the 11p13 amplicon detected in gastric cancer cell lines."Genes.Chromosomes. and Cancer. 29・4. 315-324 (2000)
• [Publications] Imoto I. et al.: "Amplification and over-expression of TGIF2, a novel homeobox gene of the TALE superclass, in ovarian cancer cell lines."Biochemical and Biophysical Research Communications. 276・1. 264-270 (2000)
• [Publications] Sugimoto N.et al.: "IQGAP1, a negative regulator of cell-cell adhesion, is up-regulated by gene amplification at 15q26 in gastric cancer cell lines, HSC39 and 40A."Journal of Human Genetics. 46・1. 21-25 (2001)
• [Publications] Yang Z-Q.et al.: "A novel amplicon at 9p23-24 in squamous cell carcinoma of the esophagus that lies proximal to GASC1 and harbors NFIB."Japanese Journal of Cancer Research. (in press). (2001)
• [Publications] Watanabe T.et al.: "A novel amplification at 17q21-23 in ovarian cancer cell lines detected by comparative genomic hybridzation."Gynecologic Oncology. (in press). (2001)