2000 Fiscal Year Annual Research Report

テロメア・バンド単位下染色体由来を同定する染色体異常の自動解析システムの開発

Research Project

Project/Area Number	12470519
Research Institution	Kyoto Prefectural University of Medicine
Principal Investigator	阿部達生京都府立医科大学, 医学部, 教授 (60079746)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	嘉数直樹京都府立医科大学, 医学部, 助手 (20264757)
Keywords	染色体異常 / SCAN法 / SKY法 / 染色体解析 / カラー分染像
Research Abstract	Gバンドに一致したバンド単位におのおの異なった色調で検出できる新しい染色体カラーバンディング法、SCAN(spectral color banding)法を開発することに成功した。原理的には、特定の染色体のほぼ全長をカバーする複数のバンド特異的なゲノムDNAをそれぞれ異なる蛍光色素の組み合わせで標識し混合したプローブを用いてSKY法で解析することでカラー分染像が得られる。さらに、われわれは、それぞれの蛍光色素の組み合わせに特有のスペクトルパターンに基づいて、どのバンド由来かを自動的に判定させることにも成功した。次に、SCAN法を腫瘍の染色体異常の解析に適用し、以下の4点で実際の染色体診断にも有用であることを明らかにした。 (1)凝縮した染色体やGバンドの質が悪い染色体標本でも、400バンドレベルに相当する明瞭なカラー分染像が得られ、安定した精度で染色体解析が可能である。 (2)由来不明の染色体片の同定が染色体単位ではなく、バンド単位で可能である。 (3)同一の染色体内でおこる構造異常(逆位、欠失、重複など)が解析可能である。 (4)染色体転座や欠失の切断点が精確に決定可能である。 SCAN法はバンド単位で染色体由来を自動的に同定できるため、これまでの肉眼によるバンドパターン認識に基づく染色体解析より、精度が飛躍的に向上することが期待できる。この方法は、将来的にはGバンドに取って代わり、さらに核型解析の完全自動化へと発展していく可能性を秘めていると言える。

Research Products

(8 results)

All Other

All Publications (8 results)

[Publications] Kakazu N, et al.: "Characterization of complex chromosomal abnormalities in B-cell lymphoma by a combined spectral karyotyping (SKY) analysis and fluorescence in situ hybridization (FISH) using a 14q telomere probe"Am J Hematol. 65. 291-297 (2000)
[Publications] Kuroda J,et al.: "Aggressive natural killer cell leukemia/lymphoma : a comprehensive cytogenetic study by spectral karyotyping."Ann Hematol. 79. 519-522 (2000)
[Publications] Kitabayashi I, et al.: "Fusion of MOZ and p300 histone acetyltransferases in acute monocytic leukemia with at(8;22)(p11;q13) chromosome translocation"Leukemia. 15. 89-94 (2001)
[Publications] Minakuchi M, et al.: "Identification and characterization of SEB,a novel protein that binds to the acute undifferentiated leukemia-associated protein SET"Eur J Biochem. 268. 1-13 (2001)
[Publications] Kakazu N, et al.: "Development of spectral color banding in cytogenetic analysis"Lancet. 357. 529-530 (2001)
[Publications] Kakazu N, et al.: "Involvement of the NUP98 gene in a chromosomal translocation t(11;20)(p15;q11.2) in a patient with acute monocytic leukemia"Int J Hematol. (in press). (2001)
[Publications] 嘉数直樹,阿部達生: "応用サイトメトリー SKY法"医学書院. 369 (2000)
[Publications] 阿部達生: "造血器腫瘍アトラス"日本医事新報社. 284 (2000)

2000 Fiscal Year Annual Research Report

テロメア・バンド単位下染色体由来を同定する染色体異常の自動解析システムの開発

Principal Investigator

阿部 達生 京都府立医科大学, 医学部, 教授 (60079746)

Research Products

[Publications] Kakazu N, et al.: "Characterization of complex chromosomal abnormalities in B-cell lymphoma by a combined spectral karyotyping (SKY) analysis and fluorescence in situ hybridization (FISH) using a 14q telomere probe"Am J Hematol. 65. 291-297 (2000)

[Publications] Kuroda J,et al.: "Aggressive natural killer cell leukemia/lymphoma : a comprehensive cytogenetic study by spectral karyotyping."Ann Hematol. 79. 519-522 (2000)

[Publications] Kitabayashi I, et al.: "Fusion of MOZ and p300 histone acetyltransferases in acute monocytic leukemia with at(8;22)(p11;q13) chromosome translocation"Leukemia. 15. 89-94 (2001)

[Publications] Minakuchi M, et al.: "Identification and characterization of SEB,a novel protein that binds to the acute undifferentiated leukemia-associated protein SET"Eur J Biochem. 268. 1-13 (2001)

[Publications] Kakazu N, et al.: "Development of spectral color banding in cytogenetic analysis"Lancet. 357. 529-530 (2001)

[Publications] Kakazu N, et al.: "Involvement of the NUP98 gene in a chromosomal translocation t(11;20)(p15;q11.2) in a patient with acute monocytic leukemia"Int J Hematol. (in press). (2001)

[Publications] 嘉数直樹,阿部達生: "応用サイトメトリー SKY法"医学書院. 369 (2000)

[Publications] 阿部達生: "造血器腫瘍アトラス"日本医事新報社. 284 (2000)

阿部達生京都府立医科大学, 医学部, 教授 (60079746)