2000 Fiscal Year Annual Research Report
DNA/RNAワールドをターゲットとする分子素材の構造基盤と機能設計
| Project/Area Number |
12480177
|
|---|
| Research Institution | Tokyo Institute of Technology |
|---|
Principal Investigator |
竹中 章郎 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (80016146)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
関口 武司 いわき明星大学, 理工学部, 教授 (00108193)
|
|---|
| Keywords | DNA / RNAワールド / リボザイム / 損傷DNA / X線解析 / ヘアピンDNA / ロイシルtRNA合成酵素 / RNA結合タンパク質 |
|---|
| Research Abstract |
本研究では、DNA/RNAワールドにおいて特異な機能をもつリボザイムなど各種のRNAやDNA、化学修飾の塩基対形成に及ぼす影響、RNAの特異領域を認識するタンパク質のX線解析によって,機能発現の詳細な構造を明らかにすることを目的として、研究計画に従って着実に進展している。今年度はX線解析の最大の関門である目的分子の結晶化を重点的に行った。その結果、高活性型deoxyribozymeの結晶化に成功し、2000年11月に岡山で開催された核酸シンポジウムで発表した。最小のリボザイムとして設計されたマキシザイムや鉛リボザイム、retro virus HIVのRNAキッシングdimerについても合成し、これらの微結晶を得た。その一部は8月に東京で開催されたRNA学会で報告した。N^4-methoxycytosineを含むDNA12量体のX線解析によって、DNA中のcytosine残基がmethoxyamineによって損傷を受けた場合の突然変異機構を明らかにし、12月に米国ホノルルで開催された環大平洋化学会議で発表した。また、活性酸素によってthymine残基が損傷を受けたDNAについてもX線解析し、8月にフランスのナンシーで開催されるヨーロッパ結晶学会年会で研究成果を発表した。高い安定性を示すヘアピン形DNAの7mer、8mer、9merについては結晶化に成功し、現在X線解析が進行中である。また、そのヘッド部分の塩基配列に変異をかけた8merについても新規の構造が得られつつある。好熱菌Bacillus stearothermophilus由来のロイシルtRNA合成酵素については、発現系の構築中である。Influenza VirusのNS1タンパク質については、そのN末ドメイン、C末ドメイン、NS1とglutathione transferaseとの融合タンパク質の発現系の構築に成功した。
|
-
[Publications] M.Tsunoda,A.Takenaka: "Crystallitation and preliminary X-ray analysis of a DNA dodecamer containing 2'-deoxy-5-formyluridine ; what is the role of magnesium……"Acta Crystallogr.. D57. 345-348 (2001)
-
[Publications] M.T.Hossain,A.Takenaka: "X-Ray analyses of two DNA dodecamers containing N^4-methoxy-cytosine paired with adenine or guanine"Nucleic Acids Symposium Series. 44. 239-240 (2000)
-
[Publications] J.Kondo and A.Takenaka: "Crystallization of the most active RNA-cleaving deoxyribozyme"Nucleic Acids Symposium Series. 44. 201-202 (2000)
-
[Publications] M.T.Hossain,…… ……A.Takenaka: "Crystallographic Studies on Damaged DNAs,III.N^4-Methoxy-cytosine conform both Watson-Crick type and wobble base……"J.Mol.Biol.. (submitted). (2001)
