2002 Fiscal Year Annual Research Report
テンサイにおける稔性回復核遺伝子のクローン化と育種利用に関する研究
Project/Area Number |
12556001
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Research Institution | Hokkaido University |
Principal Investigator |
三上 哲夫 北海道大学, 大学院・農学研究科, 教授 (50133715)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田中 征勝 独立行政法人農業技術研究機構, 北海道農業研究センター, 室長(研究職)
貴島 祐治 北海道大学, 大学院・農学研究科, 助教授 (60192556)
久保 友彦 北海道大学, 大学院・農学研究科, 講師 (40261333)
池口 正二郎 ホクレン農業組合研究所, 主任研究員
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Keywords | テンサイ / 稔性回復核遺伝子 / BACライブラリー / 共優性マーカー / TAIL PCR / コンティグ / ポジショナルクローニング / X遺伝子 |
Research Abstract |
今年度得られた研究成果は次の通りである。 [1]稔性回復核遺伝子Xを含むコンティグの作成 X遺伝争と密接に連鎖するAFLPマーカーをクローン化し、これらを用いてBACライブラリーのスクリーニングを行った。その結果、複数の陽性BACクローンが得られたので、各クローンの末端DNA配列をthermal asymmetric interlaced(TAIL)PCRまたはVectorette PCRにより調製し、各クローン間の重複関係を調査した。またコンティグ作成の過程で、コンティグ間のギャップを埋めるためクローン末端DNA配列をプローブに使ってゲノムウォーキングも試みた。現在までに、X遺伝子座周辺の900kbに亘る領域をカバーするコンティグを作成し、物理地図を試作することができた。 [2]CAPS(cleaved amplified polymorphic sequences)マーカーの作製とX座の限定 扱いが簡便で信頼度の高い共優性マーカーの1つであるCAPSマーカーを作り、連鎖分析に供した。その結果、X遺伝子座近傍に7個のCAPSマーカーを設定することができた。またX遺伝子座はコンティグ上の500kbの領域に含まれることが結論された。今後はさらに新たなDNAマーカーを設定してX遺伝子座の絞り込みを進めると同時に、シーケンス解析を開始する予定である。
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[Publications] N.Itchoda: "The sugar beet mitochondrial nad4 gene : an intron loss and its phylogenetic implication in the Caryophyllales"Theoretical and Applied Genetics. 104. 209-213 (2002)
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[Publications] N.Itchoda: "The rps4 gene in sugar beet mitochondria : insertion/deletion mutations occur within the gene but do not disrupt the reading frame"Journal of Plant Physiology. 159. 211-215 (2002)
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[Publications] N.Fujii: "Chloroplast DNA phylogeography of Fagus crenata(Fagaceae)in Japan"Plant Systematics and Evolution. 232. 21-33 (2002)
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[Publications] R.Yui: "Antisense inhibition of mitochondrial pyruvate dehydrogenase E1 α subunit in anther tapetum causes male sterility"The Plant Journal. (in press).
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[Publications] S-N.Hashida: "Temperature shift coordinately changes the activity and the methylation state of transposon Tam3 in Antirrhinum"Plant Physiology. (in press).