2002 Fiscal Year Annual Research Report
肝細胞癌特異的な遺伝子パネルおよびモノクロナル抗体による診断法の開発
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12557051
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
油谷 浩幸 東京大学, 国際・産学共同研究センター, 教授 (10202657)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山下 尚彦 (株)特殊免疫研究所, 研究員
児玉 龍彦 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (90170266)
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| Keywords | マイクロアレイ / 腫瘍マーカー / GPC 3 / 肝細胞癌 |
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| Research Abstract |
最大4万個の遺伝子について肝細胞癌組織の非癌部と癌部組織においての遺伝子発現プロファイリング解析をおこない、癌と健常部との識別、予後因子の評価を行うために階層的クラスタリングや主因子分析、SVM法などのアルゴリズムを用いて、悪性化および発癌に関わる遺伝子パネルの抽出を行った。「結節内結節」型の肝細胞癌では脱分化によるがん細胞の悪性化が認められるが、高分化型から中分化型への進展に関与すると思われる遺伝子群を抽出し、RT-PCRによる検証も行った(緑川、2002)。
腫瘍マーカーとして有用であるためには腫瘍組織での高発現だけでなく他の正常組織での低発現が必要である。GeneChipの、U133アレイAおよびBを用いた遺伝子発現プロファイル解析によりゲノム上の全遺伝子に相当する4万遺伝子の解析が可能となたっため、今年度は正常40臓器の遺伝子発現データベースも併せて作成、参照することにより、癌組織特異的に高発現する遺伝子の抽出を効率的に進めることができた。その中で高分化型肝癌においても高発現するGPC3についてはモノクロナル抗体を作製し、ELISAによる測定系を樹立した。肝細胞癌患者血清において非癌患者血清に対して有意に高濃度であることが認められ、肝硬変での疑陽性率も低く、抗体パネルを構成する一要素としてではなく、単独でも既存のマーカーであるAFPに並ぶ血清診断マーカー用臨床検査試薬として有用である可能性が高いと考えられる。
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[Publications] Kano M, Nishimura K, Ishikawa S, Tsutsumi S, Hirota K, Hirose M, Aburatani H.: "Expression Imbalance Map : A New Visualization Method for Detection of mRNA Expression Imbalance Regions"Physiol Genomics. 13(epub ahead of print). 31-46 (2003)
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[Publications] Midorikawa Y, Ishikawa S, Iwanari H, Imamura T, Sakamoto H, Miyazono K, Kodama T, Makuuchi M, Aburatani H.: "Giypican-3, overexpressed in hepatocellular carcinoma, modulates FGF2 and BMP-7 signaling"Int J Cancer. 103(4). 455-465 (2003)
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[Publications] Aburatani H.: "Understanding cancer through gene expression profiling. (review)"International Congress Series. 1246. 261-270 (2002)
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[Publications] Midorikawa Y, Tsutsumi S, Taniguchi H, Ishii M, Kobune Y, Kodama T, Makuuchi M, Aburatani H.: "Identification of genes associated with dedifferentiation of hepatocellular carcinoma with expression profiling analysis"Jpn J Cancer Res.. 93(6). 636-643 (2002)
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[Publications] Hippo Y, Taniguchi H, Tsutsumi S, Machida N, Chong JM, Fukayama M, Kodama T, Aburatani H.: "Global gene expression analysis of gastric cancer by oligonucleotide microarrays. Global gene expression analysis of gastric cancer by oligonucleotide microarrays"Cancer Research. 62(1). 233-240 (2002)
