2000 Fiscal Year Annual Research Report
TTVおよびs-TTVの分子ウイルス学的特徴と感染病理学的意義の解明
Project/Area Number |
12670223
|
Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
Principal Investigator |
阿部 賢治 国立感染症研究所, 感染病理部, 主任研究官 (60130415)
|
Keywords | TTV / Simian TTV / s-TTV / 霊長類 / チシパンジー / PCR / 分子疫学 |
Research Abstract |
ヒト以外の各種霊長類におけるTTウイルス(TTV)の感染実態を分子疫学的に検討した。その結果、TTV DNA(5'UTR)は、チンパンジー87/98(89%)、カニクイザル3/21(14%)、日本ザル1/89(1%)、アカゲザル2/127(1.6%)の血清中に検出された。さらに5'UTRにおける分子系統樹解析では、ヒトTTVとは明らかに異なる集簇を形成したためにsimian TTV(s-TTV)と仮に命名した。チンパンジー由来s-TTVから1株を選び、全長遺伝子の塩基配列を決定し、s-TTV CH65-1とした。CH65-1は、環状構造をとり、3899ntの塩基と三つのORF(ORF1:765aa,ORF2:134aa,ORF3:111aa)から構成されていた。また、114ntからなるGC-rich領域が3'UTR終末部に存在した。全塩基レベルでヒトTTVと比べると、48-54%と低い相同性を示した。以上の成績から、サル類に特有に感染しているTTVが存在することが確認できた。
|
Research Products
(6 results)
-
[Publications] Kenji Abe: "The entire nucleotide sequence of two hepatitis G virus isolates belonging to a novel genotype : Isolation in Myanmar and Vietnam."Journal of General Virology. 81. 189-194 (2000)
-
[Publications] Kenji Abe: "TT virus infection in nonhuman primates and characterization of the viral genome : Identification of simian TT virus isolates."74. 1549-1553 (2000)
-
[Publications] Kenji Abe: "High prevalence of TT virus DNA in human saliva and semen."Journal of Clinical Microbiology. 38. 2407-2408 (2000)
-
[Publications] Kenji Abe: "Simultaneous detection of hepatitis B, C and G viral genomes by multiplex PCR method."Japanese Journal of Infectious Diseases. 53. 70-72 (2000)
-
[Publications] Kenji Abe: "Full-length nucleotide sequence of a simian TT virus isolate obtained from a chimpanzee : Evidence for a new TT virus-like species."Virology. 277. 330-335 (2000)
-
[Publications] Kenji Abe: "Genotyping system of GBV-C/HGV type 1 through type 4 by polymerase chain reaction using type-specific primers and geographic distribution of viral genotypes."Journal of Virological Methods. (in press). (2000)