CDNAmicroarrayを用いた大腸癌発癌機構の解明と個人別大腸癌データベースの作成

2002 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 12671244
• Research Institution: Yokohama City University
• Principal Investigator: 石川 孝 横浜市立大学, 医学部, 助手 (80275049)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 岡崎 康司 理化学研究所, (研究職), チームリーダー (80280733) ; 林崎 良英 理化学研究所, (研究職), プロジェクトリーダー (70192705) ; 市川 靖史 横浜市立大学, 医学部, 助手 (70254208)
• Keywords: cDNA microarray / 大腸癌 / 遺伝子発現 / データ解析

Research Abstract

病理学的に診断のついた大腸腺腫、原発性大腸癌、大腸癌転移巣の計35症例をテストサンプルに用いて、大腸腫瘍の悪性状態を特徴づける遺伝子群を、Pearson correlation coefficientなどの統計学的手法を用いて試み、最終的に独自の解析方法であるAlgorithm for Diagnosing Malignant State(ADMS)を開発し、この解析方法を用いて、future sampleについても、その悪性度の予測が可能な335個の遺伝子セットを作成した。この335遺伝子には、アポトーシス、細胞回転、接着因子に属する135の既知の遺伝子が含まれていた(Biochem Biophys Res Cmmun 2002 16;296(2):497-506)。この中に、臨床に応用可能な新規遺伝子が含まれる可能性があり、現在、候補遺伝子についてgene targetingを行っている。これらの335個の遺伝子の解析が個人別データベースの作成に重要であると考えられる。
また、将来、個人別データベースをもとに、個別化した治療を行うために、ヒト大腸癌細胞株を用いた、フッ化ピリミジン系抗癌剤の感受性もしくは耐性に関与する遺伝子の解析を開始したが、3組の耐性株および親株の比較から、81遺伝子を抽出し、これらのセットがこの抗癌剤の感受性を予測しうることを細胞レベルの研究で確認でき、現在、臨床検体での解析、および、81遺伝子の確認実験を開始している。

Research Products

• [Publications] Ichikawa Y. et al.: "Identification of genes relateting colorectal carcinogenesis by using the algorithm for diagnosing malignant state method"Biochem. Biophys. Res. Commun.. 296. 497-506 (2002)
• [Publications] Nishizuka I. et al.: "Analysis of Gene Expression Involved in Brain metastasis from Breast Cancer using cDNA microarray"Breast Cancer. 9. 26-32 (2002)
• [Publications] 石川 孝 他: "マウスcDNAマイクロアレイを用いた癌関連遺伝子の発現解析"ゲノム医学. 2. 19-28 (2002)
• [Publications] 石川 孝 他: "増えた癌減った癌"総合臨床. 51. 2575-2583 (2002)
• [Publications] 石川 孝 他: "DNAマイクロアレイによるがん関連遺伝子のクローニング"血液腫瘍科. 41. 7-11 (2000)
• [Publications] 石川 孝 他: "cDNAマイクロアレイを用いた乳癌における遺伝子発現解析の臨床への応用"乳癌の臨床. 17. 18-29 (2002)