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2012 Fiscal Year Annual Research Report

寄生植物ストライガのゲノム研究

Research Project

Project/Area Number 12F02512
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

白須 賢  独立行政法人理化学研究所, 植物免疫研究グループ, グループディレクター

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) JOSIAH MuseimbiMutuku  独立行政法人理化学研究所, 植物免疫研究グループ, 外国人特別研究員
Keywords植物 / 生理学 / 病理学 / 遺伝子
Research Abstract

1年目である平成24年度はケニアからStriga hermonthicaおよびStriga asiatica種子を収集するため、ケニアの研究者とのコンタクトを開始した。IITA-Kenya BecA-ILRI HubのMorag Ferguson博士,Crop Science Department, Pwani UniversityのHemedi Mkuzi Saha教授と密接に連絡をとり、本研究の連携者として,研究に参加していただけることとなった。これによって、ケニアとの研究を推し進めることが可能となった。また本研究室において、遺伝子多様性及び形質転換に関する実験を開始した。遺伝的多様性の研究では、研究室において実験に用いる宿主植物イネ、ソルガム、トウモロコシなど、またS. hermonthicaやS. asiaticaの育成を開始した。特に宿主植物イネに感染する系をセットアップし、宿主植物イネがStrigaに感染された際のRNAを抽出した。時間を追いどのタイミングでどのような遺伝子が発現してくるかをqRT-PCRを用いて解析した。この際、植物免疫のおける遺伝子発現マーカーである、ジャスモン酸、エチレン、サリチル酸誘導遺伝子群を用いた。これらの遺伝子群が感染の初期より発現していることから、宿主植物は寄生植物を認識しており、それに対して防御するためのシステムを稼働させていることが明らかになった。さらにRNA-SEQ等を用いて詳細に解析する予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ケニア側の研究者とのコンタクトに成功し、これからの共同研究体制が構築できたことは非常に大きな成果といえる。これにより、Strigaの多様性等、ケニアでしかできない研究を遂行することが可能となった。また本研究室内において宿主植物と寄生植物の育成システムが確立できたこと、さらには感染時における遺伝子発現のパターン解析ができたことも、これからの研究を進める上での基盤が構築できたことを示している。

Strategy for Future Research Activity

Strigaと宿主植物の間にある相互関係の遺伝子転写分析を目的とした形質転換の実験は、Ishida_et_a1.(2011)及びTrick_and_Finer(1997)の手法ならびに研究室に備わる機器を用いて、Striga、ソルガム及びメイズの形質転換を実施する。アグロバクテリウムのストレインを集め、形質転換能力を判定する。また温度、ホルモン、培地、各種阻害剤などの組み合わせを試し、形質転換能力を判定する。アフリカの共同研究先であるKenya_Agricultural_Research_Institute(KARI)に赴き、サンプル収集を引き続き行う。7月に行われる国際寄生植物学会に参加し、研究発表を行う。

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Published: 2014-07-16  

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