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2014 Fiscal Year Annual Research Report

パラボド目における底棲性鞭毛虫の多様性及び魚介類寄生虫の進化的起源の解明

Research Project

Project/Area Number 12J00007
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

石川 奏太  筑波大学, 生命環境科学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywordsキネトプラスチダ類 / 魚介類寄生性鞭毛虫 / 寄生性生活様式の獲得経緯 / EST解析 / 大規模分子系統解析
Outline of Annual Research Achievements

昨年度までの成果として、キネトプラスチダ類パラボド目に属する寄生性鞭毛虫Trypanoplasma borreli(魚介類住血虫)に加え、マボヤの「被嚢軟化症」原因寄生虫であり、Hirose et al. Dis. Aquat. Organ., 97(3):227-235, 2012にてパラボド目との近縁性が示唆されたAzuminobodo hoyamushiそれぞれの大量培養を行い、Illumina Hi-seq 2000によるシーケンシングから大量のトランスクリプトームデータを得た。最終年度であるH26年度では、まず上記トランスクリプトームデータのアセンブリを行った。アセンブリ後、先行研究(Deschamps et al. Mol. Biol. Evol. 28(1):53-58. 2011)を参考に、リボソームタンパク質遺伝子など系統間で保存的な遺伝子の網羅的探索を行うことで、計43遺伝子データの取得に成功した。それぞれの遺伝子について、自由生活性鞭毛虫を含むキネトプラスチド類12種より遺伝子アライメントを構築し、計6,842アミノ酸座位からなる大規模分子系統解析用データセットを作成した。このデータセットに基づく分子系統解析により、キネトプラスチダ類内部の系統関係およびT. borreliおよびA. hoyamushiの系統的位置を頑健に推測することに成功した。最終的に、T. borreliおよびA. hoyamushiはそれぞれパラボド目、ネオボド目という異なる系統に属し、これらの寄生種への進化が独立に起こったことが示された。さらに、T. borreliがパラボド目内部の底棲性自由生活虫であるProcryptobia solokiniに最も近縁であったのに対し、A. hoyamushiは宿主であるマボヤに同じく共生するCruzella marinaに最も近縁であることも示され、両者の寄生性獲得経緯に違いがあることが示唆された。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (5 results)

All 2015 2014

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Non-Homogeneous置換モデルに基づく進化系統樹推測のMPI/OpenMP HYBRID並列化:大規模計算システム向けプログラムの開発と性能評価.2014

    • Author(s)
      石川奏太, 中尾昌広, 稲垣祐司, 橋本哲男, 佐藤三久.
    • Journal Title

      情報処理学会論文誌

      Volume: 7(3) Pages: 13-24

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Palpitomonas bilix presents a basal cryptist lineage: insight into the character evolution in Cryptista.2014

    • Author(s)
      Yabuki A, Kamikawa R, Sohta A. Ishikawa, Kolisko M, Kim E, Tanabe AS, Kume K, Ishida K, Inagaki Y.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 4(4641) Pages: 1-6

    • DOI

      10.1038/srep04641

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 43遺伝子系統解析により解明されたキネトプラスチダ類における寄生性形質獲得プロセス.2015

    • Author(s)
      矢﨑裕規、石川奏太、久米慶太郎、谷藤吾朗、釜石隆、橋本哲男、稲垣祐司.
    • Organizer
      第84回日本寄生虫学会大会
    • Place of Presentation
      杏林大学、東京都、三鷹市
    • Year and Date
      2015-03-21 – 2015-03-22
  • [Presentation] キネトプラスチダ類における寄生性鞭毛虫の系統的位置と寄生性形質獲得プロセスの解明.2014

    • Author(s)
      矢﨑裕規、石川奏太、久米慶太郎、谷藤吾朗、釜石隆、橋本哲男、稲垣祐司.
    • Organizer
      日本進化学会第16回大会
    • Place of Presentation
      高槻現代劇場、大阪府、高槻市
    • Year and Date
      2014-08-21 – 2014-08-24
  • [Presentation] Inter- or Intra-genomic gene conversions between peptide-chain release factor paralogs in Bacteroidetes.2014

    • Author(s)
      Sohta Ishikawa, Kamikawa R, Inagaki Y.
    • Organizer
      Evolution 2014
    • Place of Presentation
      ノースカロライナ州、米国
    • Year and Date
      2014-06-20 – 2014-06-24

URL: 

Published: 2016-06-01  

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