2003 Fiscal Year Annual Research Report
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13132207
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| Research Institution | Kansai University |
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Principal Investigator |
大矢 裕一 関西大学, 工学部, 助教授 (10213886)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山名 一成 姫路工業大学, 大学院・工学研究科, 助教授 (70192408)
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| Keywords | デオキシリボ核酸 / 自己組織化 / 光エネルギー移動 / 人工光合成システム / 蛍光プローブ / 相補的水素結合 / フェムト秒パルスレーザー / 時間分解蛍光スペクトル |
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| Research Abstract |
今年度は,DNA二重鎖上でのクロモフォアの空間配置および距離とエネルギー移動との関連について明らかにするため,20残基DNAの5'末端にアクセプタークロモフォアとしてヘキサクロロフルオレセイン(Hex)を導入し,ドナークロモフォアとなるフルオレセイン(Flu)をそのDNA,あるいは相補鎖の任意の場所に導入したコンジュゲート群を合成し,二重鎖状態でのクロモフォア間の距離とエネルギー移動との関連について検討した。
Hexを1本のDNA鎖(A鎖)の5'末端に有し,Fluを同一鎖(A鎖)上で5残基離れた位置にFluを導入したもの(A6Flu1Hex+B),同様に8残基離れた位置にFluを導入したもの(A11Flu1Hex+B),および相補鎖(B鎖)上で6残基離れた位置にFluを導入したもの(B15Flu+A1Hex),同様に相補鎖(B鎖)上で16残基離れた位置にFluを導入したもの(B5Flu+A1Hex)を調製し,クロモフォア・アレイを構築した。これらを二重鎖形成状態で蛍光スペクトル測定を行った。これらの結果より,予想していた通り,クロモフォア間の距離が長くなるほど光エネルギー移動の効率は低下する傾向が認められた。しかし,ドナークロモフォアがアクセプタークロモフォアと同一鎖にある場合と相補鎖上にある場合とでは,エネルギー移動効率の値に大きな差が見られ,同一鎖にある方がエネルギー移動効率が高くなった。また,同じ10残基を介した場合であっても,以前に報告していたような,10残基の5'末端にクロモフォアを導入してマトリックスDNA上で配列化させたパターンよりも,同一鎖に導入した場合の方がエネルギー移動効率が高くなることが明らかとなった。
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Research Products
(7 results)
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[Publications] Y.Ohya(他4名): "Multi-Step Fluorescence Resonance Energy Transfer in Sequential Chromophore Array Constructed on Oligo-DNA Assemblies"Bioconjugate Chem.. 14(6). 1057-1066 (2003)
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[Publications] K.Yamana(他5名): "Electrochemical Detection of Single-Base Mismatches in DNA by a Redox-Active Intercalator Conjugated Oligonucleotide"Nucleic Acids Research Supplement. 3. 89-90 (2003)
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[Publications] A.Mahara, K.Yamana(他4名): "Detection of Acceptor Sites for Antisense Oligonucleotides on Native Folded RNA by Fluorescence Spectroscopy"Bioorganic & Medicinal Chemistry. 11. 2783-2790 (2003)
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[Publications] K.Yamana(他3名): "Bis-Pyrene Labeled DNA Aptamer as an Intelligent Fluorescent Biosensor"Biooraganic & Medicinal Chemistry Letters. 13(20). 3429-3431 (2003)
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[Publications] 大矢裕一: "DNA分子組織体上でのクロモフォアの配列化"オレオサイエンス. 4(1). 5-10 (2004)
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[Publications] Y.Ohya(他2名): "Formation of Polymeric Assembly by Anti-Directed Oligo-DNA Dimers"Supramol.Chem.. 6(3). 157-163 (2004)
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[Publications] Y.Ohya(他5名): "Energy Transfer Behavior in Chromophore Array Constructed by DNA Assembly in the Presence of Polycationic Graft Copolymer"Biomolecular Chemistry-A Bridge for the Future. 387 (2003)
