2004 Fiscal Year Annual Research Report
ゲノムの死と再生:DNA二重鎖切断とその帰結のバイオロジー
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13141201
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
小林 一三 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授 (30126057)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
板谷 光泰 三菱化学生命科学研究所, 主任研究員
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| Keywords | ゲノム / 制限酵素 / 遺伝子増幅 / ゲノム再編 / 枯草菌 / ゲノム工学 / 比較ゲノム / 感染症 |
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| Research Abstract |
小林:
<A.制限酵素修飾酵素遺伝子の自己増殖>BamHI制限酵素修飾酵素遺伝子枯れ草菌での自己増幅が、自然形質転換による別の細胞へ導入と染色体に組み込まれる過程で、頻度の上昇をもたらすかを検討し、予備的な結果を得た。BamHI制限酵素修飾酵素遺伝子の枯草菌染色体での自己増幅をレポーターによって検出するための菌株を構築した。
<B.制限修飾遺伝子喪失の帰結>大腸菌が増殖中にEcoRI制限修飾遺伝子を喪失した時に起きる変化を追跡する。EcoRI制限酵素修飾酵素を抗体で検出して両酵素の安定性を調べた。ゲノム再編とりわけ、制限修飾遺伝子の転移を検討する。
<C.非染色体DNAに対する制限酵素の攻撃と帰結>III型およびI型制限修飾遺伝子の攻撃によってドライブされるDNAの切断と修復を、ファージで解析した。
<D.自発およびDM損傷による染色体切断と帰結>いくつかの生理的条件で、大腸菌の各種の変異体での大きな切断染色体をパルスフィールドゲル電気泳動で解析した。
<E.ゲノム比較>近縁の細菌ゲノム配列を比較し、ゲノム再編の痕跡を探索した。NeisseriaとStaphylococcus aureusについて進めた。
板谷:
新規な構造のバクテリア(枯草菌)ゲノムをデザインするために、大規模な2重逆位変異を誘導するシステムの構築に取り組んだ。1種類の薬剤耐性マーカーで2重変異を起こした株を得た。
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