2002 Fiscal Year Annual Research Report

AFLP法によるウシ・ゲノム解析とその応用

Research Project

Project/Area Number	13460126
Research Institution	KOBE UNIVERSITY
Principal Investigator	辻荘一神戸大学, 農学部, 教授 (10031220)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	万年英之神戸大学, 農学部, 助教授 (20263395) 向井文雄神戸大学, 農学部, 教授 (50093323)
Keywords	黒毛和種 / マーカーアシスト選抜 / AFLP / 育種価 / 雌牛の改良 / 牛の品種鑑定 / SNPs
Research Abstract	1)黒毛和種とホルスタイン種及びそのF1を識別できるDNA断片の検索;約2000プライマーにおよぶAFLP分析を行った結果、黒毛和種とホルスタイン種の識別に有効なAFLP断片45マーカーを開発した。これらのAFLP断片を利用して、黒毛和種とホルスタイン種およびそのF1の識別を行ったところ、夫々100頭レベルでの比較ではあるが,それらの品種を識別できることが明らかとなった。今後は、AFLPマーカーの由来となっている塩基置換の個所(SNPs)を明らかにし、PCR-RFLP法やマイクロアレー法によって、簡便に塩基置換を認識し、品種の識別に利用できるようにすることが必要である。 2)黒毛和種繁殖集団内での脂肪交雑の育種価で区分した上位25頭と下位23頭の雌牛のDNAを入手し,160プライマーセット、2,000DNA多型マーカーを目標に上下を区分できるAFLPマーカーの開発を行った。16種類のグループ特異的なマーカーが得られた。それらを使って、育種価の予測値とDNAマーカーから推定した総合遺伝子型値との関連を見たところ、r=0.92の極めて高い相関が得られた。そこで,次に,頭数を169頭にまで増加させ、育種価の予測値とDNAマーカーから推定した総合遺伝子型値との関連を見たところr=0.70の有意な相関が得られた。牛枝肉では,脂肪交雑評点とロース信面積との間には相関がある。そこで,ロース芯面積の予測育種価と総合遺伝子型値との関係も調査した所,r=0.63の有意な相関がまたしても得られた。このような手法による、牛の育種改良の試みは無いので、ここで開発した方法を用いれば、DNA多型情報を用いて牛を選抜するマーカーアシスト選抜が実現する事になる。これまでAFLP法のこのような利用は家畜では行われていないので、その成果は画期的なものである。また,この方法は牛に限らず、あらゆる家畜や植物の育種改良に利用可能で,その意味でも画期的な手法の出現となった。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] Mannen H.: "Identification of mitochondrial DNA substitutions related to meat quality in Japanese Black cattle"J. Anim. Sci.. 81. 68-73 (2003)
[Publications] Shimogiri T.: "Linkage mapping of the mitochondrial aconitase (ACO2) gene to chicken chromosome 1"Anim. Genet.. 29. 1 (2002)
[Publications] Lee Un Jun: "Localization of the muscular dystrophy AM locus using a chicken linkage map constructed with the Kobe University resource family"Anim. Genet.. 33. 42-48 (2002)
[Publications] Mannen H.: "Mitochondrial DNA reveal that domestic goat (Capra hircus) are genetically affected by two subspecies of bezoar (Capra aegagurus)"Biochem. Genet.. 39. 145-154 (2001)
[Publications] 笹崎晋史: "AFLPマーカーを用いた肉用牛5品種の系統分析"日本畜産学会報. 72. J1-J5 (2001)
[Publications] Oyama, K.: "Heritability and repeatability estimated for reproductive traits of Japanese Black cows."Asia-Australian J. Anim. Sci.. 15. 1680-1685 (2002)
[Publications] 辻荘一: "動物遺伝育種学事典"シュプリンガー・ヘアラーク東京. 636 (2001)

2002 Fiscal Year Annual Research Report

AFLP法によるウシ・ゲノム解析とその応用

Principal Investigator

辻 荘一 神戸大学, 農学部, 教授 (10031220)

Research Products

[Publications] Mannen H.: "Identification of mitochondrial DNA substitutions related to meat quality in Japanese Black cattle"J. Anim. Sci.. 81. 68-73 (2003)

[Publications] Shimogiri T.: "Linkage mapping of the mitochondrial aconitase (ACO2) gene to chicken chromosome 1"Anim. Genet.. 29. 1 (2002)

[Publications] Lee Un Jun: "Localization of the muscular dystrophy AM locus using a chicken linkage map constructed with the Kobe University resource family"Anim. Genet.. 33. 42-48 (2002)

[Publications] Mannen H.: "Mitochondrial DNA reveal that domestic goat (Capra hircus) are genetically affected by two subspecies of bezoar (Capra aegagurus)"Biochem. Genet.. 39. 145-154 (2001)

[Publications] 笹崎晋史: "AFLPマーカーを用いた肉用牛5品種の系統分析"日本畜産学会報. 72. J1-J5 (2001)

[Publications] Oyama, K.: "Heritability and repeatability estimated for reproductive traits of Japanese Black cows."Asia-Australian J. Anim. Sci.. 15. 1680-1685 (2002)

[Publications] 辻 荘一: "動物遺伝育種学事典"シュプリンガー・ヘアラーク東京. 636 (2001)

辻荘一神戸大学, 農学部, 教授 (10031220)

[Publications] 辻荘一: "動物遺伝育種学事典"シュプリンガー・ヘアラーク東京. 636 (2001)