ミトコンドリアゲノム全塩基配列に基づく上位真骨類大分類群の再検討

2001 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 13640711
• Research Institution: Natural History Museum and Institute, Chiba
• Principal Investigator: 宮 正樹 千葉県立中央博物館, 動物学研究科, 上席研究員 (30250137)
• Keywords: ミトコンドリアゲノム / 真骨魚類 / 分子系統学 / 大規模データセット / ロングPCR / 単系統群 / 大分類群 / 側棘鰭類

Research Abstract

諸説入り乱れている上位真骨魚類(とくに棘鰭類内部)系統解明の第一段階として,どのような包括的単系統群が認められ,それらがどのような相互関係をもつのか,計48種の真骨魚類から得られたミトコンドリアゲノム全塩基配列データを用いて大域的な系統解析を行った(Miya et al.2001)、その結果,さまざまな統計値によって強く支持される頑健な系統樹が得られ,系統樹の最上位に位置するスズキ類(Percomorpha)を除く上位真骨類系統の概容が明らかになった.それとともに,いくつかの分類群(側棘鰭類・キンメダイ目・カンムリキンメダイ目)について系統学的問題が存在することが明らかになった.
そこで,この問題に対処すべくこれら3つの分類群と他の上位真骨類から新たに計54種をリストアップし,これらのミトコンドリアゲノム全塩基配列を決定した.計100種からなる形質行列を作成し,系統解析を行った結果,側棘鰭類についてはまったく系統学的実体がない分類群であることが判明し,キンメダイ目とカンムリキンメダイ目は側系統群であることが明らかになった、以上の結果はMajor Patterns of Higher Teleostean Phylogerues : A New Perspective Based on 100 Complete Mitochondrial DNA SequencesとしてMolecular Phylogenetics ＆ Evol ution誌に投稿中である.

Research Products

• [Publications] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of Conger myriaster (Teleostei : Anguillioformes): Novel gene order for vertebrate mitochondrial genornes and the phylogenctic implications for anuuilliform families"Journal of Molecular Evolution. 52(3). 311-320 (2001)
• [Publications] Ishiguro, N., M.Miya, M.Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of ayu, Plecoglossus altivelis"Fisheries Science. 67(4). 474-481 (2001)
• [Publications] Kawaguchi, A., M.Miya, M.Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of Aulopus japonicus (Teleostei : Aulopiformes),a basal Eurypterygii : Longer DNA sequences and the higher-level relationships"Ichthyological Research. 48(3). 213-223 (2001)
• [Publications] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida.: "A miltogenomic perspective on the basal teleostean phylogeny : Resolving higher-level relationships with longer DNA sequences"Molecular Phylogenetics and Evolution. 20(2). 275-285 (2001)
• [Publications] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida.: "Complete mitochondrial DNA sequence of the Japanese anchovy, Engraulis japonicus"Fisheries Science. 67(5). 828-835 (2001)
• [Publications] Miya, M., A.Kawaguchi, M.Nishida: "Mitogenomic exploration of higher teleostean phylogenies : A case study for moderate-scale evolutionary genomics with 38 newly-determined complete mitochondrial DNA sequences"Molecular Biology and Evolution. 18(11). 1993-2009 (2001)