SAGE法を利用したグリオーマ特異的遺伝子の単離と迅速遺伝子診断への応用

2002 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 13671465
• Research Institution: Keio University
• Principal Investigator: 戸田 正博 慶應義塾大学, 医学部, 助手 (20217508)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 河瀬 斌 慶應義塾大学, 医学部, 教授 (40095592) ; 河上 裕 慶應義塾大学, 医学部, 教授 (50161287)
• Keywords: グリオーマ / 遺伝子診断 / SAGE / GeneChip / 脳 / 網羅的解析

Research Abstract

近年、未知の分子を含む遺伝子発現量を定量的にかつ大量に解析する方法として、S4GE法(Serial Analysis of Gene Expression)が開発された。SAGE法は遺伝子と一対一に対応すると考えられる約10bpの塩基配列をtagとして、大量に塩基配列解析を行なうものであり、定量的な遺伝子発現解析が可能である。本研究では、グリオーマの遺伝子診断法の開発を月的として、網羅的遺伝子発現解析によるグリオーマ抗原分子の同定を行なった。実際のSAGE解析はNCI(National Cancer Institute)データベース上に公開されているグリオーマをはじめとする各種癌および正常組織の遺伝子発現解析プロファィルを利用して行った。さらiこ我々はAffyimetrix社のGenechipを用いて、正常脳組織とグリオーマ組職における網羅的な遺伝子発現解析を行い、データベースを利用したSAGE解析と組み合わせることで、より糖度の高い体系的な遺伝子発現解析を行った。これらの解析結果より、正常脳組織と比較してグリオーマにおいて高い発現を示す遺伝子群、グリオーマ抗原候補遺伝子を選出した。さらにこれら候補遺伝子の正常組織および腫瘍組織における遺伝子発現をRT-PCR法により解析したところ、正常組織と比較してグリオーマにおいて高い発現を示すグリオーマ抗原分子が同定された。現在、定量的な発現解析を行うためのプライマーやPCR条件の最適化を行っており、今後、迅速遺伝子珍断への応用を検討してゆく予定である。

Research Products

• [Publications] Endo T, Toda M, Watanabe M, Iizuka Y, Kubota T, Kitajima M, Kawakami Y: "In situ cancer vaccination with a replication-conditional HSV for the treatment of liver metastasis of colon cancer"Cancer Gene Ther. 9. 142-148 (2002)
• [Publications] Toda M, Iizuka Y, Kawase T, Uyemura K, Kawakami Y: "Immuno-viral therapy of brain tumors by combination of viral therapy with cancer vaccination using a replication-conditional HSV"Cancer Gene Ther. 9. 356-364 (2002)
• [Publications] Mikami Y, Toda M, Watanabe M, Nakamura M, Toyama Y, Kawakami Y: "A simple and reliable behavioral analysis of locomotor function after spinal cord injury in mice"J Neurosurg. 97. 142-147 (2002)
• [Publications] Masahiro Toda: "Immuno-viral therapy as new approach for the treatment of brain tumor"Drug News Perspect. (in press).
• [Publications] Toda M, Kawakami Y: "Cancer vaccine and immunotherapy for brain tumors"Curr Pharm Des. (in press).
• [Publications] 戸田正博, 戸山芳昭: "樹状細胞"臨床整形外科. 137・6. 732-733 (2002)
• [Publications] 戸田正博, 岡野栄之: "神経幹細胞と中枢神経再生"炎症・再生. 22・5. 469-473 (2002)
• [Publications] 戸田正博: "腫瘍ワクチン療法"Clinical Neuroscience. (in press).
• [Publications] 戸田正博: "免疫系に認識されるグリオーマ抗原"中外医学社. 15 (2002)
• [Publications] 戸田正博: "先端医療シリーズ18:脳神経外科「脳腫瘍の最新医療」"先端医療技術研究所. 7 (2002)