RNA性転移因子(SINEとLINE)の動物ゲノム内転移の誘発と検出

2001 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 13680759
• Research Institution: Tokyo Institute of Technology
• Principal Investigator: 岡田 典弘 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (60132982)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 大島 一彦 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 講師 (60282852)
• Keywords: LINE / SW1 / レトロポジション / メダカ

Research Abstract

メダカのLINEであるSW1の転移を検出するために、EGFPカセットを用いた。EGFPはGFP(緑色蛍光タンパク質)が改良されたもので、カセット自体の内部にはイントロンが逆向き(アンチセンスな向き)に挿入されている。すなわち、3'UTRにEGFPカセットを挿入されたSW1は、I)転写後にEGFPカセット内のイントロンがスプライシングを受け、II)翻訳を受けて自身のエンドヌクレアーゼおよび逆転写酵素ドメインによってゲノムの新たな部位に挿入およびcDNA合成をする。すると、III)転移したSW1に由来するEGFPが翻訳を受けるとGFPを検出することができる。
EGFPカセットを持つコンセンサスなSW1をメダカ_アクチンのプロモーターの下流に挿入したプラスミド(pOBA-SW1-EGFP)を構築した。メダカ_アクチンのプロモーターを持つGFP発現ベクターは、ヒトおよびメダカの培養細胞で過剰発現を可能とする。そこでまず、pOBA-SW1-EGFPをHeLa細胞にトランスフェクションしたところ、GFPの発現は全く観察されなかった。っまりヒト細胞において、メダカLINE(SW1)の転移活性は検出できなかった。次にメダカ培養細胞および受精卵で同様に行なう予定である。
SW1がHeLa細胞において転移を検出できなかった理由としては、(a)SW1が宿主特異的である、(b)EGFPカセットが挿入されている3'UTRに、逆転写反応の際に何らかの認識機構が関与しているためにcDNAが合成されなかった、(c)SW1自体の転移活性が検出できないほど低い、といった可能性が考えられる。LINEの宿主依存性は排除できないため、メダカ培養細胞および1細胞期の胚を用いて、SW1の転移を調べるつもりである。

Research Products

• [Publications] Ikuo Ogiwara, Masaki Miya, Kazuhiko Ohshima, Norihiro Okada: "V-SINEs : A New Superfamily of Vertebrate SINEs That Are Widespread in Vertebrate Genomes and Retain a Strongly Conserved Segment within Each Repetitive Unit"Genome Research. 12. 316-324 (2001)