2001 Fiscal Year Annual Research Report
ゲノム構成要素としての転移因子の組み換え機構解析のためのバキュロウイルスの利用
Project/Area Number |
13876077
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Research Category |
Grant-in-Aid for Exploratory Research
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Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
Principal Investigator |
前川 秀彰 国立感染症研究所, 放射能管理室, 室長 (60100096)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
松浦 善治 大阪大学, 微生物病研究所・エマージング感染症研究センター, 教授 (50157252)
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Keywords | レトロトランスポゾン / BMC1 / カイコ / LINE1 / R1Bm / R2Bm / 逆転写酵素 / エンドヌクレアーゼ |
Research Abstract |
レトロトランスポゾンは転移因子として分類されているが、キイロショウジョウバエのテロメアにおける末端保護配列という新たな機能を獲得したように、染色体の重要な構成要素として位置付けることが出来る。この視点から、ゲノムへのそれらの挿入機構を解析することは、染色体そのものの成り立ちを探る上で重要な意味をもつ。 そのためにバキュロウイルスに組み込んだ効率の良い解析系を使用したカイコnon-LTR型レトロトランスポゾンBMC1の挿入機構の解析進めることにした。この解析系を利用してリポゾーマルDNAクラスターに特異的に挿入されているレトロトランスポゾンR2Bmを解析した結果、エンドヌクレアーゼと逆転写酵素のORFを一つしか持たないR2Bmは、Terminal Primed Reverse、Transcription(TPRT)反応により3'末端は挿入できるが、5'末端は挿入できなかった。そこで将来的にも利用範囲の広いgag様配列を含むORF1とエンドヌクレアーゼと逆転写酵素を含むORF2をもつBMC1を候補に選んだ。われわれが単離した配列はORF1を含まなかったので、ORF1及びORF2を含む配列をPCR法により構築し、バキュロウイルスへの組み込みを進めている。コードしている配列が確かに目的のペプチドに変換されるかを検証するために、エンドヌクレアーゼ・ドメインをクローン化し大腸菌中でペプチドを生成しそのアミノ酸配列をGCマス・スペクトロメーターで解析し目的のペプチドを確認した。ORF1を持つモデルとしてリポゾーマルDNA特異的に挿入が起こるR1BmについてもPCR法でクローン化しバキュロウイルスへの組み込みを進めている。
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[Publications] Moriishi K., Koura M., Matsuura Y.: "Induction of Bad-mediated Apoptosis by Sindbis Virus Infection : Involvement of Pro-survival Members of the Bcl-2 Family"Virology. (in press).
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[Publications] Matsuura Y., Tani H., Suzuki K., Someya T., Suzuki R., Hideki A., Ishii K., Moriishi K., Robison C.S., Whitt M.A., Miyamura T.: "Characterization of Pseudotype VSV Possessing HCV Envelope Proteins"Virology. 286. 263-275 (2001)
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[Publications] Funatsuki, K., Hashido, K., Matsunami, M., Kameoka, Y., Iwabuchi, K., Tsukeda, H., Tuchida, K., Takada, N., Nakajima, Y., Maekawa, H.: "Rapid identification of Bombyx mori cells using PCR amplification following a direct procedure for genomic DNA preparation"J. Insect Biotechnology and Sericology. 70. 129-136 (2001)
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[Publications] Tani H., Nishijima M., Ushijima H., Miyamura T., Matsuura Y.: "Characterization of cell surface determinants important for baculovirus infection"Virology. 279. 343-353 (2001)