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2014 Fiscal Year Annual Research Report

プロテオミクス、バイオインフォマティクス、イメージングによる表皮ガン治療法の研究

Research Project

Project/Area Number 13F03918
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

WADHWA Renu  独立行政法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 首席研究員 (30371090)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) SINGH Rajkumar  独立行政法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywordsプロテオミクス / イメージング / 癌 / CARF
Outline of Annual Research Achievements

上皮膜抗原(EMA)は、がん細胞において異常な翻訳後修飾を受け、より少ないO-グリカン鎖を持つ。そのような低グリコシル化EMA抗原(uEMA)は、露出していないタンパク質領域の露出を引き起こし、正常および腺ガン表面上皮を区別する抗体生成などの免疫反応を導く。がん細胞におけるEMAの増強発現は悪性細胞の生存を促進させるため、EMAはがん治療の標的として役立つことが予想される。本研究では、分子学的、バイオインフォマティクス、イメージング解析によりがんの標的としてのEMAを評価する。そして、がん細胞におけるシアリル-Lea、-Lex、-Tnなどの腫瘍関連ネオマーカーの翻訳後のグリコシル化特性を解析し、モータリン、CARF、p53などの腫瘍促進や抑制に関与するタンパク質との相互作用を調べる。
本年度、EMAのグリコシル化経路のバイオインフォマティクス解析、共発現マッピングを行った。シアリル-Lea、-Tnネオマーカーを含むグリコシル化経路の分析は多種類の方法で取り組んだ。また、遺伝子オントロジー解析では、ゴルジ管腔、タンパク質結合、細胞外小胞、細胞質機能におけるタンパク質プロセシング、細胞膜でのグリコシル化等の複数の重要な細胞機能において、EMAが関与することが予測された。さらに、がん細胞の細胞増殖及びDNA損傷反応におけるCARFとEMAの役割についても調べた。EMAのモチーフ検索は、腫瘍関連ネオマーカーを標的とするための、免疫反応性抗原認識エピトープの同定に繋がると考えられる。p53欠損細胞におけるCARFのp53下流制御の機能的関与とその影響について、細胞増殖、増殖抑制、DNA損傷、アポトーシス、腫瘍形成でのそれらの役割の特性解析を行っている。発がんにおけるCARFの役割について、DNA損傷シグナリング経路やテロメア制御機序を分子的にまたイメージング解析により調べている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

これまでに、ストレスタンパク質CARFが用量に依存して、相反する細胞の増殖および停止を制御することを明らかにしてきた。がん細胞の細胞増殖およびDNA損傷反応におけるEMAとCARFの役割についても解析を進めている。本年度、成果を学会や誌上等で発表し、社会に発信することができた。

Strategy for Future Research Activity

引き続き、バイオインフォマティクス、モチーフ検索や分子の刺激的アプローチにより、EMAの免疫反応性エピトープを同定する。また、CARFの過剰発現および低発現細胞を作製し、特性解析を進める。

  • Research Products

    (8 results)

All 2015 2014

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] A bioinformatics prediction approach towards analyzing the glycosylation, co-expression and interaction patterns of epithelial membrane antigen (EMA/MUC1)2015

    • Author(s)
      Kalra RS and Wadhwa R.
    • Journal Title

      AIP Conf. Proc.

      Volume: 1649 Pages: 141

    • DOI

      10.1063/1.4913559

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Collaborator of ARF (CARF) regulates proliferative fate of human cells by dose-dependent regulation of DNA damage signaling2014

    • Author(s)
      Cheung CT, Singh R, Kalra RS, Kaul SC, Wadhwa R.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 289 Pages: 18258-18269

    • DOI

      10.1074/jbc.M114.547208

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular characterization of collaborator of ARF (CARF) as a DNA damage response and cell cycle checkpoint regulatory protein2014

    • Author(s)
      Singh R, Kalra RS, Hasan K, Kaul Z, Cheung CT, Huschtscha L, Reddel RR, Kaul SC, Wadhwa R.
    • Journal Title

      Exp. Cell. Res.

      Volume: 322 Pages: 324-334

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2014.01.022.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] CARF (Collaborator of ARF) is a two-way regulator of cancer cell proliferation2015

    • Author(s)
      Kalra RS, Chaudhary A, Prakash J, Kaul S, and Wadhwa R.
    • Organizer
      34th Annual Convention of Indian Association for Cancer Research (IACR)
    • Place of Presentation
      ジャイプール(インド)
    • Year and Date
      2015-02-19 – 2015-02-21
  • [Presentation] Cell Stress Marker protein-CARF2014

    • Author(s)
      Kalra RS, Kaul S, and Wadhwa R.
    • Organizer
      5th Symposium of the Indian Scientists Association in Japan (ISAJ) on Advances in Natural Sciences & Technologies
    • Place of Presentation
      インド大使館(東京都千代田区)
    • Year and Date
      2014-12-01 – 2014-12-01
  • [Presentation] p53 tumor suppressor protein is essential for CARF (Collaborator of ARF)-induced growth arrest in cancer cells2014

    • Author(s)
      Kalra RS, Prakash J, Kaul S, and Wadhwa R.
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [Presentation] Tumor-associated Epithelial Membrane Antigen (EMA) Glycosylation as a Potential Diagnostic Tool or Therapeutic Target for Epithelial Malignancies2014

    • Author(s)
      Kalra RS, Chaudhary A, Kaul S, and Wadhwa R.
    • Organizer
      IRAGO Conference 2014
    • Place of Presentation
      産業技術総合研究所(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2014-11-06 – 2014-11-07
  • [Presentation] p53 tumor suppressor is essential for CARF-induced proliferation control comprising modulation of DNA-Damage response signaling2014

    • Author(s)
      Kalra RS, Singh R, Nigam N, Kaul S, and Wadhwa R.
    • Organizer
      日本組織培養学会第87回大会
    • Place of Presentation
      星陵会館(東京都千代田区)
    • Year and Date
      2014-05-29 – 2014-05-30

URL: 

Published: 2016-06-01  

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