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2015 Fiscal Year Annual Research Report

PPR蛋白質を利用した標的RNA特異的改変システムの開発

Research Project

Project/Area Number 13J04569
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

八木 祐介  九州大学, 農学研究院, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
KeywordsRNA / PPR / RNA分解
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、植物のみで非常に拡大したRNA結合蛋白質ファミリーであるPPR蛋白質に着目し。その特性を利用することで様々なRNA配列に結合する人工RNA結合蛋白質を構築し、RNaseをそれと融合することで標的特異的な細胞内RNA分解系を作成しようというものである。昨年度までに、1. 動物培養細胞を用いたPPR蛋白質とRNAの結合の検出システム、2.任意RNA配列に結合するPPR蛋白質の作成方法について確立できた。現状では成功確率は低いが、完成したカスタムPPR蛋白質を用いて、RNA分解酵素や翻訳抑制因子のようなエフェクタードメインを連結し、細胞内mRNAの翻訳抑制手法の構築を目標に今年度は研究を行った。まず、既知の様々なRNase domainや翻訳抑制因子などをcloningし、それらと昨年度作成したPPR蛋白質を融合し、reporter assayを用いてRNA分解、翻訳抑制効果を検証した。その結果、最大で50%程の標的蛋白質の抑制効果が見られた。さらに、翻訳抑制可能なドメインのスクリーニングが完了したので、実際に内在遺伝子を標的でき、発現抑制が可能なカスタムPPR蛋白質を作成した。その結果、内在mRNAに対しても検証を行い、20-30%程度ではあるが、抑制効果が見られた。今後、PPRと抑制ドメイン間のリンカー配列の検討や、PPR蛋白質の発現安定性などを改良し最適化することで、さらに機能的な人工RNaseが作成できると考えている。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2016 2015

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Development of genome engineering tool(s) by plant specific PPR proteins using animal cultured cell2016

    • Author(s)
      T. Kobayashi, Y. Yagi, T. Nakamura.
    • Journal Title

      Methods in Mol. Biol

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] PPRモチーフを用いたDNA/RNA操作技術2016

    • Author(s)
      八木祐介、中村崇裕
    • Journal Title

      科学評論社「内分泌・糖尿病・代謝内科」

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

  • [Presentation] PPRタンパク質を利用した標的特異的なmRNA翻訳制御ツールの開発2016

    • Author(s)
      八木祐介、中村崇裕
    • Organizer
      植物生理学会
    • Place of Presentation
      岩手
    • Year and Date
      2016-03-18 – 2016-03-20
  • [Presentation] PPR蛋白質を利用した標的mRNA特異的な翻訳制御ツールの開発2015

    • Author(s)
      八木祐介、中村崇裕
    • Organizer
      分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04

URL: 

Published: 2016-12-27  

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