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2015 Fiscal Year Annual Research Report

非リン酸化およびリン酸化タウタンパク質と微小管の結合自由エネルギー計算

Research Project

Project/Area Number 13J07605
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

梅澤 公二  早稲田大学, 理工学術院, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords天然変性タンパク質 / タウタンパク質 / リン酸化 / 微小管 / 自由エネルギー計算
Outline of Annual Research Achievements

本研究の対象であるタウタンパク質は生理的条件下で単体では一定の立体構造を形成せず、多くの準安定な立体構造集団を成す天然変性タンパク質であり、多数のリン酸化サイトをもつ。とくにT231とS262のリン酸化タウタンパク質は微小管との結合親和性を低下させる。そのリン酸化による微小管との結合親和性変化について立体構造集団を算出することで明らかにすることが本研究の目的である。
タウタンパク質は441アミノ酸残基の大きな超多自由度な系である。そこで、我々は研究期間中に粗視化モデルを開発・発展させることで計算を可能にした。当初の目標であるタウタンパク質の非リン酸化体、T231リン酸化体、S262リン酸化体、T231S262両リン酸化体だけではなく、αシヌクレインやKIDのリン酸化体、そしてタウ断片の4リン酸化体についても立体構造集団を算出することができた。そこで、リン酸化による分子内応答の共通性を明らかにすることができた。
さらに粗視化モデルの開発を進めたことで、タウタンパク質と微小管との結合計算を実施することができた。これまで知られていたタウの微小管結合部位を計算から再現できただけではなく、T231リン酸化による分子内応答部位がタウ-微小管結合に関与している示唆を得ることができた。以上の研究成果は学術学会にて報告を行なった。
加えて、天然変性タンパク質がもつ立体構造の多様性(分子のやわらかさ)と結合親和性および結合/解離速度の関連性を粗視化モデルによって明らかにすることができた(Proteins 2016 in press)。
よって、本研究を遂行することで、当初の目標以上の天然変性タンパク質のリン酸化による分子内応答と結合親和性変化を明らかにすることができ、粗視化モデルの開発・発展を実施できた。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2016 2015

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Enhanced sampling simulations to construct free-energy landscape of protein–partner substrate interaction2016

    • Author(s)
      J. Ikebe, K. Umezawa, and J. Higo.
    • Journal Title

      Biophysical Reviews

      Volume: 8 Pages: 45-62

    • DOI

      0.1007/s12551-015-0189-z

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Intrinsic disorder accelerates dissociation rather than association2016

    • Author(s)
      K. Umezawa, J. Ohnuki, J. Higo, and M. Takano
    • Journal Title

      Proteins: Structure, Function and Bioinformatics

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1002/prot.25057

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 微小管の天然変性領域の構造分布から見るその重要性2016

    • Author(s)
      梅澤公二
    • Organizer
      第4回天然変性蛋白質計算科学セミナー
    • Place of Presentation
      静岡県
    • Year and Date
      2016-01-07 – 2016-01-07
  • [Presentation] 粗視化シミュレーションで探る天然変性蛋白質 タウのリン酸化による分子内応答2015

    • Author(s)
      梅澤公二、大貫隼、水原志暢、高野光則
    • Organizer
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      徳島県
    • Year and Date
      2015-06-24 – 2015-06-24

URL: 

Published: 2016-12-27  

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