2002 Fiscal Year Annual Research Report

ES細胞を用いた未分化細胞が分化する過程の網羅的解析

Research Project

Project/Area Number	14011259
Research Institution	The Institute of Physical and Chemical Research
Principal Investigator	丹羽仁史理化学研究所, 多能性幹細胞研究チーム, チームリーダー (80253730)
Keywords	ES細胞 / 分化 / マイクロアレイ
Research Abstract	テトラサイクリンで転写因子Oct-3/4の発現を調節することが可能なES細胞ZHBTc4において、テトラサイクリン投与後0,24,48、72、96時間目の細胞からそれぞれRNAを精製し、これを始原生殖細胞由来cDNAマイクロアレイで解析し、全ての結果の収集を完了した(理化学研究所・阿部博士との共同研究)。一方で、これらのサンプルをNIHの洪博士との共同研究により、23K cDNAマイクロアレイを用いても解析を進めている。今後、全てのデータの収集が完了次第、その解析に着手する予定である。テトラサイクリンで転写因子Gata6の発現を調節することが可能なES細胞G6SKOについては、その発現によって誘導される細胞が壁側内胚葉であることを最終的に確認した(Fujikura J et al.,Genes Dev.,2002)ので、現在マイクロアレイ解析用の時系列RNAサンプルを収集している。また、最近ES細胞における遺伝子マーキングによる解析から、従来均一と考えられていたOct-3/4を発現する未分化細胞集団が、さらに遺伝子発現パターンの異なるサブグループに分離可能であることを見出した。現在、これらのサブグループを系統的に純化する方法の開発を進めており、その進捗を見た後に、マイクロアレイを用いた系統的遺伝子発現解析に進む予定である。マイクロアレイ法による遺伝子発現解析の有効性は、洪博士との共同研究によるES細胞とTS(trophoblast stem)細胞の遺伝子発現比較検討により確認することが出来ているので(Tanaka, TT et al., Genome Res.,2002)、今後同様の手法を用いた上記サンプルの解析結果から、細胞分化のメカニズムの一端が明らかにされるであろう。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] Tateishi, S., et al.: "Enhanced genomic instability and defective postreplication repair in RAD18-knockout mouse embryonic stem cells"Mol Cell Biol. 23・2. 474-481 (2003)
[Publications] Niwa, H., et al.: "Phenotypic complementation establishes requirements for specific POU domain and generic transactivation function of Oct-3/4 in embryonic stem cells"Mol Cell Biol. 22・5. 1526-1536 (2002)
[Publications] Takashima, S., et al.: "Targeting of both mouse neuropilin-1 and neuropilin-2 genes severely impairs developmental yolk sac and embryonic angiogenesis"Proc Natl Acad Sci USA. 99・6. 3657-3662 (2002)
[Publications] Fujikura, F., et al.: "Differentiation of embryonic stem cells is induced by GATA factors"Genes & Dev. 16・7. 784-789 (2002)
[Publications] Tomioka, M., et al.: "Identification of Sox-2 reguratory region which is under the control of Oct3/4-Sox-2 complex"Nucleic Acids Res. 30・14. 3202-3213 (2002)
[Publications] Tanaka, T.T., et al.: "Gene expression profiling of embryo-derived stem cells reveals candidate genes associated with pluripotency and lineage specificity"Genome Res. 12・12. 1921-1928 (2002)
[Publications] 丹羽仁史: "誘導的発現システム開発の現状"医学のあゆみ. 623-627 (2002)

2002 Fiscal Year Annual Research Report

ES細胞を用いた未分化細胞が分化する過程の網羅的解析

Principal Investigator

丹羽 仁史 理化学研究所, 多能性幹細胞研究チーム, チームリーダー (80253730)

Research Products

[Publications] Tateishi, S., et al.: "Enhanced genomic instability and defective postreplication repair in RAD18-knockout mouse embryonic stem cells"Mol Cell Biol. 23・2. 474-481 (2003)

[Publications] Niwa, H., et al.: "Phenotypic complementation establishes requirements for specific POU domain and generic transactivation function of Oct-3/4 in embryonic stem cells"Mol Cell Biol. 22・5. 1526-1536 (2002)

[Publications] Takashima, S., et al.: "Targeting of both mouse neuropilin-1 and neuropilin-2 genes severely impairs developmental yolk sac and embryonic angiogenesis"Proc Natl Acad Sci USA. 99・6. 3657-3662 (2002)

[Publications] Fujikura, F., et al.: "Differentiation of embryonic stem cells is induced by GATA factors"Genes & Dev. 16・7. 784-789 (2002)

[Publications] Tomioka, M., et al.: "Identification of Sox-2 reguratory region which is under the control of Oct3/4-Sox-2 complex"Nucleic Acids Res. 30・14. 3202-3213 (2002)

[Publications] Tanaka, T.T., et al.: "Gene expression profiling of embryo-derived stem cells reveals candidate genes associated with pluripotency and lineage specificity"Genome Res. 12・12. 1921-1928 (2002)

[Publications] 丹羽 仁史: "誘導的発現システム開発の現状"医学のあゆみ. 623-627 (2002)

丹羽仁史理化学研究所, 多能性幹細胞研究チーム, チームリーダー (80253730)

[Publications] 丹羽仁史: "誘導的発現システム開発の現状"医学のあゆみ. 623-627 (2002)