2002 Fiscal Year Annual Research Report
NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
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14026013
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
嶋田 一夫 東京大学, 大学院・薬学系研究科, 教授 (70196476)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
寺沢 宏明 東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助手 (10300956)
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| Keywords | 安定同位体標識 / 多次元NMR法 / CPD photolyase / 光回復酵素 / NMR |
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| Research Abstract |
安定同位体標識DNA光産物の調製に成功し、多次元NMR法によるNMRシグナル帰属が完了した。高度好熱菌由来のCPD photolyase(阪大・院理・倉光博士より大腸菌発現系が供与された)を題材として、紫外線損傷DNA (CPD)と修復酵素の相互作用を原子レベルで明らかにしている。CPD photolyaseの精製法については、従来法に改善を加え、活性体の効率的精製に成功した。光回復酵素との複合体におけるCPDのNMRシグナル帰属を進めるとともに、安定同位体標識法の確立を行った。DNA-酵素複合体のような高分子量複合体では、上記の解析で用いた^<13>C、^<15>N標識試料以外に、さらに^2H標識を施したCPDを調製する必要がある.この三重標識CPDと光回復酵素との複合体の多次元多核種NMR解析を行うことで、標識CPDのNMRシグナルの帰属を行い、NOEやスピン結合などのNMR構造情報をもとに複合体形成時におけるCPDのコンホメーションの決定を行った。さらに、変異体による解析や蛍光標識DNAなどを用いて構造情報を確認し、修復酵素による損傷部位の特異的認識メカニズムおよび反応機構を明らかにした。
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[Publications] Tamiji Nakanishi: "Determination of the Interface of a Large Protein Complex by Transferred"J. Mol. Biol. 318. 245-249 (2002)
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[Publications] Koh Takeuchi: "Solution Structure of ω-Grammotoxin SIA, a gating modifier of P/Q and N"J. Mol. Biol.. 321. 517-526 (2002)
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[Publications] Yoshimasa Kyogoku: "Structural Genomics of Membrane Proteins"Accounts. Chem. Res.. (in press).
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[Publications] Yoshitomo Suhara: "Oligomers of Glycamino Acid"Bioorgan. Med. Chem.. 10. 1999-2013 (2002)
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[Publications] Noritaka Nishida: "Backbone ^1H,^<13>C,^<15>N resonance assignments of the vo Willebrand"J. Biomol. NMR. (in press).
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[Publications] Noritaka Nishida: "Novel Collagen-Binding Mode of the VWA Domain Determined"Nature Struct. Biol.. (in press).
