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2004 Fiscal Year Annual Research Report

トラフグのポストゲノム解析に関する基礎研究

Research Project

Project/Area Number 14104008
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

渡部 終五  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (40111489)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鈴木 譲  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (40107412)
落合 芳博  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (50160891)
末武 弘章  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助手 (00334326)
Keywordsトラフグ / ゲノム / 筋分化 / ミオシン / MyoDファミリー / 連鎖地図 / 生体防御 / 胚発生
Research Abstract

1.既存のトラフグゲノムデータベース、BACおよびコスミド末端・内部配列データベースを使用し、トラフグミオシン重鎖遺伝子クラスターの物理マップを作成した。この際、公開されているミドリフグおよびゼブラフィッシュのゲノム配列を利用し、トラフグで不足しているゲノム配列データを補完した。その結果、トラフグ速筋型ミオシン重鎖遺伝子は5つの領域に存在し、そのうち3領域でクラスターを形成していた。しかしながら、魚類で得られたミオシン重鎖遺伝子クラスターは、哺乳類のクラスターとは進化的に異なる祖先遺伝子から形成されたことが示唆された。
2.トラフグの温度適応機構を明らかにするため、淡水魚でみつかった高温馴化特異的タンパク質Wap65のcDNAクローニングを行った。その結果、以前メダカで得られた2種類のアイソフォームがトラフグにおいても存在することが明らかとなった。
3.QTL解析により遺伝的に優良な品種を確立することを目的として、マイクロサテライトマーカーを用いてトラフグ連鎖地図を作成した。確立した66マーカー中、41マーカー座で遺伝子型が決定でき、この結果を基にメスでは10連鎖群上に26マーカーを、オスでは9連鎖群上に19マーカーからなる連鎖地図を作成することができた。
4.免疫機構の調節に関わる因子であるサイトカインのうち、IL-2、IL-6、IL-15およびIFN-γの機能を解明するため、cDNAクローニングを行うとともに、組換えタンパク質作製のための発現ベクターを構築した。
5.CD抗原に対するモノクローナル抗体をDNA免疫法により作製した。CD3およびCD4に対して抗体価の上昇が認められなかったが、CD8では抗体価の上昇が認められたため、脾臓を摘出し、常法によりモノクローナル抗体の作出を行った。ウェスタンブロットの結果、得られた血清は組換えCD8αに対して反応することが示された。

  • Research Products

    (7 results)

All 2005 2004 2003 Other

All Journal Article (6 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Genomic structural analysis of the pufferfish (Takifugurubripes) skeletal myosin heavy chain genes2005

    • Author(s)
      Daisuke Ikeda et al.
    • Journal Title

      Marine Biotechnology (in press)

  • [Journal Article] Isolation of microsatellite markers by in silico screening implicated for genetic linkage mapping in Japanese pufferfish Takifugu rubripes2004

    • Author(s)
      Satoshi Furukawa et al.
    • Journal Title

      Fisheries Science 70

      Pages: 620-628

  • [Journal Article] Cloning, expression, and characterization of fugu CD4, the first ectothermic animal CD42004

    • Author(s)
      Hiroaki Suetake et al.
    • Journal Title

      Immunogenetics 56

      Pages: 438-447

  • [Journal Article] Characterization and expression of the immunoglobulin light chain in the Fugu : evidence of a solitaire type2004

    • Author(s)
      Nil Ratan Saha et al.
    • Journal Title

      Immunogenetics 56

      Pages: 47-55

  • [Journal Article] トラフグ・ゲノム:脊椎動物で最も小さいサイズ2004

    • Author(s)
      池田大介, 渡部終五
    • Journal Title

      蛋白質 核酸 酵素 49

      Pages: 2235-2241

  • [Journal Article] Primary structures and gene organization of two types of WAP65 from the pufferfish Takifugu rubripes2003

    • Author(s)
      Makoto Hirayama et al.
    • Journal Title

      Fish Physiology and Biochemistry 29

      Pages: 211-224

  • [Book] トラフグの全ゲノム解析はなぜ行われたか-データベースの値打ちと魚類ゲノム科学の新展開.海洋生命系のダイナミクス(塚本勝巳編)

    • Author(s)
      池田大介, 渡部終五
    • Publisher
      東海大学出版会(印刷中)

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Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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