2003 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノム情報と発現プロファイルを用いた転座関連遺伝子による腫瘍化の分子機構の解析

Research Project

Project/Area Number	14370242
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	井田孔明東京大学, 医学部附属病院, 助手 (60313128)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	康勝好東京大学, 医学部附属病院, 助手 (50359618) 小林美由紀東京大学, 医学部附属病院, 講師 (60205391)
Keywords	遺伝子 / ゲノム / バイオテクノロジー / マイクロアレイ / 癌
Research Abstract	今年度は2qの相手遺伝子とNUP98の新しい転座相手遺伝子HDXC11を単離した。さらに転座型急性リンパ性白血病(ALL)の新鮮検体を用いて、転座の相手による発現の相違をDNA Chipを用いて検索し、下流の標的遺伝子を探索した。t(4;11) 15検体、t(11,19) 6検体、t(5;11) 2検体および対照としてt(12;21) 6検体、t(1;19) 3検体からRNAを抽出し、Affymetrix社のDNA Chip (12,000個)により発現プロファイルの解析を行った。t(4;11)とt(11;19)の両方に共通して発現がみられる遺伝子がFLT3, HOXA9, HOXA10等50種にみられた。興味あることにMLL再構成のある21検体中予後による発現パターンの相違がみられ(p=0.01)、CBF2遺伝子が予後良好群で、CDP遺伝子が予後不良群で高発現を示した。また21例で共通して発現が高かったFLT3遺伝子の変異を調べたところ、乳児ALL 44例中8例(18%)で変異がみられた。また小児ALL 112例で検討したところ、高2倍体ALL 19例中4例(21.5%)に変異がみられたが、TEL-AML1 11例、E2A-PBX1 4例、BCR-ABL 6例では変異はみられなかった。DNA Chipで抽出された遺伝子の発現を定量reverse transcliptase (RT)-PCRでチェックしたところ、ほぼアレイの発現と一致していた。MLL再構成例の共通の標的遺伝子および転座相手の相違によるMLLのキメラ遺伝子の下流の標的遺伝子の相違を探索するため、これらの遺伝子を詳細に検討し、共通する下流遺伝子をしぼる作業を進めている。また昨年単離したMLL-SEPT6融合cDNAを導入した細胞をマウスに移植し、増殖や造腫瘍性の検討も行っている。

Research Products

(11 results)

All Other

All Publications (11 results)

[Publications] Xinh PT: "The breakpoints at 1p36.3 detected with BAC/PAC probes in three MDS/AML(M4) patients with t(1;3)(p36;q21) translocation : in the first intron and in the 5' region of MEL1."Genes Chromosome Cancerr. 36・3. 313-317 (2003)
[Publications] Terui, K: "Successful treatment of acute myelomonocytic leukaemia with NUP98-HOXD11 fusion transcripts and monitoring of minimal residual disease."Br.J.Haematol. 120・2. 274-276 (2003)
[Publications] Hiwatari M: "Fusion of an AF4-related gene, LAF4, to MLL in childhood acute lymphoblastic leukemia with t(2;11)(q11;q23)."Oncogene. 22・18. 2851-2855 (2003)
[Publications] Taketani T: "AML1/RUNX1 mutations are infrequent, but related to AML-M0, acquired trisomy 21, and leukemic transformation in pediatric hematologic malignancies"Genes Chromosomes Cancer. 38・1. 1-7 (2003)
[Publications] Echlin-Bell DR: "Polymorphisms in the MLL breakpoint cluster region (BCR)."Hum Genet. 113・1. 80-91 (2003)
[Publications] Chen YY: "Genomic structure and mutational analysis of the human KIF1Balpha gene located at 1p36.2 in neuroblastoma."Int J Oncol. 23・3. 737-744 (2003)
[Publications] Xu G: "Frequent mutations in the GATA-1 gene in the transient myeloproliferative disorder of Down syndrome."Blood. 102・8. 2960-2968 (2003)
[Publications] Tsutsumi S: "Two distinct gene expression signatures in pediatric acute lymphoblastic leukemia with MLL rearrangements."Cancer Res. 63・16. 4882-4887 (2003)
[Publications] Hirose Y: "Comprehensive analysis of gene alterations in acute megakaryoblastic leukemia of Down's syndrome."Leukemia. 17・11. 2250-2252 (2003)
[Publications] Obana K: "Aberrations of p16INK4A, p14ARF and p15INK4B genes in pediatric solid tumors."Int J Oncol.. 23・4. 11511-11577 (2003)
[Publications] Taketani T: "FLT3 mutations in the activation loop of tyrosine kinase domain are frequently found in infant acute lymphoblastic leukemia (ALL) with MLL rearrangement and pediatric ALL with hyperdiploidy."Blood. 103・3. 1085-1088 (2004)

2003 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノム情報と発現プロファイルを用いた転座関連遺伝子による腫瘍化の分子機構の解析

Principal Investigator

井田 孔明 東京大学, 医学部附属病院, 助手 (60313128)

Research Products

[Publications] Xinh PT: "The breakpoints at 1p36.3 detected with BAC/PAC probes in three MDS/AML(M4) patients with t(1;3)(p36;q21) translocation : in the first intron and in the 5' region of MEL1."Genes Chromosome Cancerr. 36・3. 313-317 (2003)

[Publications] Terui, K: "Successful treatment of acute myelomonocytic leukaemia with NUP98-HOXD11 fusion transcripts and monitoring of minimal residual disease."Br.J.Haematol. 120・2. 274-276 (2003)

[Publications] Hiwatari M: "Fusion of an AF4-related gene, LAF4, to MLL in childhood acute lymphoblastic leukemia with t(2;11)(q11;q23)."Oncogene. 22・18. 2851-2855 (2003)

[Publications] Taketani T: "AML1/RUNX1 mutations are infrequent, but related to AML-M0, acquired trisomy 21, and leukemic transformation in pediatric hematologic malignancies"Genes Chromosomes Cancer. 38・1. 1-7 (2003)

[Publications] Echlin-Bell DR: "Polymorphisms in the MLL breakpoint cluster region (BCR)."Hum Genet. 113・1. 80-91 (2003)

[Publications] Chen YY: "Genomic structure and mutational analysis of the human KIF1Balpha gene located at 1p36.2 in neuroblastoma."Int J Oncol. 23・3. 737-744 (2003)

[Publications] Xu G: "Frequent mutations in the GATA-1 gene in the transient myeloproliferative disorder of Down syndrome."Blood. 102・8. 2960-2968 (2003)

[Publications] Tsutsumi S: "Two distinct gene expression signatures in pediatric acute lymphoblastic leukemia with MLL rearrangements."Cancer Res. 63・16. 4882-4887 (2003)

[Publications] Hirose Y: "Comprehensive analysis of gene alterations in acute megakaryoblastic leukemia of Down's syndrome."Leukemia. 17・11. 2250-2252 (2003)

[Publications] Obana K: "Aberrations of p16INK4A, p14ARF and p15INK4B genes in pediatric solid tumors."Int J Oncol.. 23・4. 11511-11577 (2003)

[Publications] Taketani T: "FLT3 mutations in the activation loop of tyrosine kinase domain are frequently found in infant acute lymphoblastic leukemia (ALL) with MLL rearrangement and pediatric ALL with hyperdiploidy."Blood. 103・3. 1085-1088 (2004)

井田孔明東京大学, 医学部附属病院, 助手 (60313128)