• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2002 Fiscal Year Annual Research Report

造血系転写調節因子の活性調節機構の分子構造学的研究

Research Project

Project/Area Number 14380296
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

緒方 一博  Yokohama City University, 医学部・生化学第一, 教授 (90260330)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 佐藤 光  横浜市立大学, 生化学第一医学部, 助手 (90300962)
Keywords転写因子 / エンハンセオソーム / X線結晶構造解析 / 原子間力顕微鏡 / c-Myb / Runx1 / c-Ets-1 / C / EBP
Research Abstract

1.プロモーターDNA上でのエンハンセオソーム構造形成機構の解析
一般的に、転写因子は広い範囲のプロモーターDNA領域に複数結合し、さらに転写因子同士が互いに結合してエンハンセオソームと呼ばれる超分子会合体を形成し、転写を活性化する。我々はこのエンハンセオソーム構造の最も典型的な基本単位の一つと考えられる,c-Myb-C/EBP-DNA複合体の相互作用様式を原子レベルで解析している。c-MybとC/EBPは協調的に造血系の標的遺伝子を活性化するが,この転写因子間の協調活性に必要なプロモーターDNA配列を調べると,転写因子結合部位だけでなく,その周辺のDNA配列も厳密に規定されていることがわかってきた。現在,c-Myb結合部位の近傍のDNA塩基配列がエンハンセオソーム形成にどのような効果を持つかを調べるため、c-Myb結合塩基配列近傍に変異を導入したプロモーターDNAを調製し、c-Mybタンパク質の変異プロモーターへの結合をSurface Plasmon Resonance (SPR)法で詳細に解析すると共に、各変異プロモーターのエンハンセオソーム形成に与える影響を解析する目的で,原子間力顕微鏡(AFM)を用いた複合体の画像化による実験を進めているところである。
2.Runx1とc-Ets-1タンパク質による協調的転写機構の解明
T Cell Receptor α(TCRα)遺伝子は、転写因子Runx1とc-Ets-1によって協調的に転写が促進される。この協調性がどのような機構で起こるのか、その原子レベルでの報告は未だなされていない。そこでこの機構を原子レベルで解明するために、TCRαプロモーターDNA, Runx1, c-Ets-1からなる複合体のX線結晶構造解析を行う準備を進めている。現在、協調性を示すそれぞれの転写因子の最小領域の決定、大量発現、精製法の確立を行っている。

  • Research Products

    (6 results)

All 2003 2002

All Journal Article (6 results)

  • [Journal Article] Eukaryotic transcriptional regulatory complexes: cooperativity from near and afar2003

    • Author(s)
      Ogata, K., Sato, K., Tahirov, T. H.
    • Journal Title

      Curr. Opin. Struct. Biol. 13

      Pages: 40-48

  • [Journal Article] プロモーターDNA上での転写制御因子会合体の形成と転写調節の分子機構2003

    • Author(s)
      緒方一博
    • Journal Title

      日本結晶学会誌 45

      Pages: 19-25

  • [Journal Article] Mechanism of c-Myb-C/EBP. cooperation from separated sites on a promoter2002

    • Author(s)
      Tahirov TH, Sato K, Ichikawa-Iwata, E, Sasaki M, Inoue-Bungo T, Shiina M, Kimura, K., Takata, S., Fujikawa, A., Morii, H., Kumasaka, T., Yamamoto M., Ishii, S., Ogata, K.
    • Journal Title

      Cell 108

      Pages: 57-70

  • [Journal Article] Structural aspects of gene expression by AML1/CBE,c-Myb, AMV v-Myb, C/EBP. and Ets-12002

    • Author(s)
      Tahirov, T. H., Sato, K, Inoue-Bungo, T., Ichikawa-Iwata, E., Sasaki, M., Fujikawa, A., Shiina, M., Takata, S., Kimura, K., Morii, H., Kumasaka, T., Yamamoto, M., Ishii, S., Ogata, K.
    • Journal Title

      Acta Cryst. A58Supplement

      Pages: C20

  • [Journal Article] 構造解析のための試料調製(総論)-タンパク質-DNA複合体を中心として-2002

    • Author(s)
      緒方一博
    • Journal Title

      遺伝子医学 6

      Pages: 86-95

  • [Journal Article] 分子構造から見たRunxタンパク質によるDNA認識とその制御2002

    • Author(s)
      緒方一博
    • Journal Title

      細胞工学 21

      Pages: 1216-1219

URL: 

Published: 2010-01-29   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi