2002 Fiscal Year Annual Research Report

人種判定用DNA多型検査システムの研究

Research Project

Project/Area Number	14570384
Research Institution	Shinshu University
Principal Investigator	太田正穂信州大学, 医学部, 講師 (50115333)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	浅村英樹信州大学, 医学部, 助手 (80324250) 高柳カヨ子信州大学, 医学部, 助手 (60313847) 福島弘文信州大学, 医学部, 教授 (70135218) 猪子英俊東海大学, 医学部, 教授 (10101932)
Keywords	HLA / ハプロタイプ / DNA多型 / PCR / SPP
Research Abstract	"人種判定用DNA多型検査システムの研究"を遂行するために、本年度は、多型性に富むHLA型に関して研究した。問題点として、単一民族(例えば、近接する日本人と韓国人)を識別する特徴的なアリルを選出することは非常に困難であったが、民族学から民族に特徴的なハプロタイプ解析を行うことにより日本人の特徴が見いだすことが可能であった。日本人に特徴的で、韓国、北部中国にも見られるが、他のアジア集団ではみられないハプロタイプはA24-B52-DR15-DQ6(8.4%),A33-B44-D13-DQ6(4.0%),A24-B7-DR1-DQ5(4.1%),A24-B46-DR8-DQ6(2.2%>が挙げられた。また、B44を含むハプロタイプでは、日本人には全く見られていないA29-B44-DR7-DQ2が白人特異的なものであり、A29-B44-DR11は黒人特徴的なものであった。さらに、日本人には全く見られず、白人に見られるハプロタイプは、A3-B35-DR1,A3-B7-DR2,A1-B7-DR3が見られた。以上よりこのようなハプロタイプを推定できるHLA-DNA検査キットの構築を実施した。また、法医実務では、検査資料が微量であることから、通常の検査法では多型性に富み、民俗学的なデータも蓄積されているHLAシステムの検査が困難であることが解った。そのため、検体量が微量(10ng)でHLA-A-B,-DR-DQ座が検査可能なHLA-SPP (Sequence Specific Primer and Probe:ゲノムサイエンス社)法を用いて、パラフィン切片、毛髪、陳旧血痕、唾液から得たDNAを用いて検討したところ、今までの方法ではタイピングが困難であった微量試料からのHLA判定が可能となった。この方法はHLAの法医学領域での検査に有効であることが実証された。

Research Products
(6 results)

All Other

All Publications (6 results)

[Publications] 赤松泰次他3名: "生体標本の個人識別法-検体取り違えの事故防止策-"消化器内視鏡. 14・3. 385-389 (2002)
[Publications] Kawa S, Ota M, 他10名: "HLADRBl*0405-DQBl*0401 haplotype is associated with autoimmune pancreatitis in the Japanese population"Gastroenterology. 122. 1264-1269 (2002)
[Publications] Tsjimura A, Ota M 他8名: "Susceptibility gene for non-obstractive azoospermia located near HLA-DR and-DQ loci m the HLA class II region"Hum Genet. 110. 192-197 (2002)
[Publications] Asamura A, Ota M 他4名: "Molecular genetic analysis of the Am phenotype of the ABO blood group system"Vox Sanguinis. 83. 263-267 (2002)
[Publications] Tsukada K, Ota M 他3名: "Multiplex short tandemrepeat typing m degraded samples using nearly designed primers for the THSl, TPOX, CSFIPO, and vWA lci"Legal Medicine. 4. 239-245 (2002)
[Publications] Mizuki N, Ota M, 他11名: "Analysis of microsatellite polymorphism around the HLA-B loacs m Iranian patients with Be hcet's disease"Tissue Antigens. 60. 396-399 (2002)

2002 Fiscal Year Annual Research Report

人種判定用DNA多型検査システムの研究

Principal Investigator

太田 正穂 信州大学, 医学部, 講師 (50115333)

Research Products

[Publications] 赤松泰次 他3名: "生体標本の個人識別法-検体取り違えの事故防止策-"消化器内視鏡. 14・3. 385-389 (2002)

[Publications] Kawa S, Ota M, 他10名: "HLADRBl*0405-DQBl*0401 haplotype is associated with autoimmune pancreatitis in the Japanese population"Gastroenterology. 122. 1264-1269 (2002)

[Publications] Tsjimura A, Ota M 他8名: "Susceptibility gene for non-obstractive azoospermia located near HLA-DR and-DQ loci m the HLA class II region"Hum Genet. 110. 192-197 (2002)

[Publications] Asamura A, Ota M 他4名: "Molecular genetic analysis of the Am phenotype of the ABO blood group system"Vox Sanguinis. 83. 263-267 (2002)

[Publications] Tsukada K, Ota M 他3名: "Multiplex short tandemrepeat typing m degraded samples using nearly designed primers for the THSl, TPOX, CSFIPO, and vWA lci"Legal Medicine. 4. 239-245 (2002)

[Publications] Mizuki N, Ota M, 他11名: "Analysis of microsatellite polymorphism around the HLA-B loacs m Iranian patients with Be hcet's disease"Tissue Antigens. 60. 396-399 (2002)

太田正穂信州大学, 医学部, 講師 (50115333)

[Publications] 赤松泰次他3名: "生体標本の個人識別法-検体取り違えの事故防止策-"消化器内視鏡. 14・3. 385-389 (2002)

[Publications] Kawa S, Ota M, 他10名: "HLADRBl0405-DQBl0401 haplotype is associated with autoimmune pancreatitis in the Japanese population"Gastroenterology. 122. 1264-1269 (2002)