骨髄異形成症候群におけるt(1;7)転座およびdel(7q)のゲノム解析

2003 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 14570962
• Research Institution: The UNIVERSITY OF TOKYO
• Principal Investigator: 小川 誠司 東京大学, 医学部附属病院, 寄附講座教員(常勤形態) (60292900)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 半下石 明 東京大学, 医学部附属病院, 助手 (20344450) ; 黒川 峰夫 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (80312320) ; 千葉 滋 東京大学, 医学部附属病院, 助教授 (60212049) ; 鈴木 隆浩 東京大学, 医学部附属病院, 寄附講座教員(常勤形態) (40345210) ; 神田 善伸 東京大学, 医学部附属病院, 助手 (30334379)
• Keywords: t(1;7)(q10;p10) / del(7q) / メチル化解析 / 骨髄異形成症候群 / アルフォイド配列 / CpGアイランド / メチル化パターン / MDS

Research Abstract

不均衡型転座t(1;7)(q10;p10)および腕内欠失del(7q)は、骨髄異形成症候群(MDS)で比較的高頻度に認める染色体異常である。これらの染色体異常を有する症例の予後は極めて不良であって、その分子病態の解明が強く希求されるところである。そこで、本研究では、これらの転座のゲノム解析を行うことにより、その分子病態を明らかにすることを試みた。
まず、t(1;7)転座の転座切断点に関しては、1番、7番の動原体近傍のalphoid配列D1Z7およびD7Z1をプローブとした定量的FISH解析により、本転座は、DNA複製後にこれらの領域で生じた二重鎖切断が相同組み換えにより修復される際に生じる可能性が強く示唆された。また、その転座切断点の分布が症例により大きく異なることから、本転座による白血病化のメカニズムとしては、1pのtrisomyないし7qのmonosomyが重要であると考えられた(Wang et al. Blood.102:2597-2604,2003)。
そこで、t(1;7)およびdel(7q)で共通して遺伝子doseの低下を伴う7番染色体長腕(7q)について、メチル化という観点から、その標的遺伝子の候補を探索した。すなわち、7qに存在するCpGアイランドのうち、PCR増幅可能な130個(約60%)に関して、bisulfite-PCR払および直接塩基配列決定法によりMDSを含む造血器腫瘍検体におけるメチル化の有無を網羅的に解析した。その結果、培養腫瘍細胞株と患者検体ではメチル化の程度には明確な差異が認められるものの、メチル化を受けやすいCpGアイランドは両者で共通しておりかつ、7q上クラスターをなして存在することが明かとなった。さらに、高頻度に腫瘍特異的メチル化を受けるCpGアイランドの下流に存在する20個の遺伝子に関して、その発現とメチル化との相関解析により、MDSにおける7qの標的癌抑制遺伝子の候補として、PFTK1およびQ9P1T7を同定した。

Research Products

• [Publications] Kawazu M, Ogawa S, et al.: "A prospective comparison of diagnostic potentials of the real-time PCR, double sandwich ELISA for galactomannan, and (1→3)-b-D-glucan test in weekly screening for invasive aspergillosis in patients with hematological disorders."Journal of Microbiology. (In Press). (2004)
• [Publications] Ichikawa M, Ogawa S, et al.: "AML-l is required for megakaryocytic maturation and lymphocytic differentiation, but not for maintenance of hematopoietic stem cells in adult hematopoiesis."Nature Medicine. 10. 299-304 (2004)
• [Publications] Wang L, Ogawa S, et al.: "Molecular characterization of the recurrent unbalanced translocation der(1;7)(q10;p10)."Blood. 102. 2597-2604 (2003)
• [Publications] Qiao Y, Ogawa S, et al.: "Identification of a novel fusion gene, TTL, fused to ETV6 in acute lymphoblastic leukemia with t(12;13)(p13;q14), and its implication in leukemogenesis."Leukemia. 17. 1112-1120 (2003)
• [Publications] Nakamura F, Ogawa S, et al.: "Should young patients with e19a2 type BCR/ABL rearrangement undergo stem cell transplantation?"Leuk Lymphoma. 44. 381-382 (2003)
• [Publications] Hosoya N, Ogawa S, et al.: "Molecular cytogenetic analyses of HIG, a novel human cell line carrying t(1;3)(p36.3;q25.3) established from a patient with chronic myelogenous leukemia in blastic crisis."Int J Hematol. 78. 432-438 (2003)