2003 Fiscal Year Annual Research Report
DNAプールを用いたマイクロサテライトマーカーによる2型糖尿病全ゲノム相関解析
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14571096
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| Research Institution | Ehime University |
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Principal Investigator |
牧野 英一 愛媛大学, 医学部, 教授 (50009578)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大沼 裕 愛媛大学, 医学部, 助手 (00294794)
大澤 春彦 愛媛大学, 医学部, 助教授 (90294800)
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| Keywords | 糖尿病 / 感受性遺伝子 / SNP / 多型 / ハプロタイプ |
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| Research Abstract |
糖尿病発症予防法の確立には感受性遺伝子の同定が必須である。そこで本研究では、DNAプールを用いて全ゲノムをスクリーニングし、日本人の2型糖尿病感受性マーカーあるいは原因遺伝子を同定することを目的とする。
当初は、DNAプールを用いて、マイクロサテライトによる全ゲノムのスクリーニングを計画していた。一方、申請者らも参加しているミレニアムプロジェクトにおいて、マイクロサテライト及びSNPを用いた全ゲノム解析が順調に進行し、一次スクリーニングが終了する見通しとなった。更に平成15年には2次スクリーニングが開始され、その結果同定された感受性座位の解析の一部を担う方が良いと考えられる状況に至った。
そこで、脂肪細胞に特異的に発現する転写因子FOXC2、及びインスリンの抗脂肪分解作用を媒介するphophodiesterase 3B (PDE3B)、resistinについて解析を進めることにした。これらは、2型糖尿病におけるインスリン抵抗性の有力な候補遺伝子である。
まず、2型糖尿病24名についてFOXC2の全エクソン及び1kbの5'flanking領域をPCR直接シークエンス法によりスクリーニングした。同定したSNPを、対照200名、2型195名で解析した。その結果、対照で-512C>T(32.3%)、-350G>T(13.0%)、+1548C>T(10.0%)を同定した。これらのSNP及び4種の主要ハプロタイプはいずれも2型とは関連しなかった。
また、PDE3Bについては、高頻度のSNP-465G>T及び+1389G>Aについて、対照200名、2型207名をタイピングした。各SNP単独、及びハプロタイプは2型と関連しなかった。
また、ResistinのSNP299G>Aはインスリン抵抗性症候群と関連を認めなかった。以上より、FOXC2及びPDE3B遺伝子のSNPは、日本人2型糖尿病感受性に影響する主要な因子ではないことが想定された。
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[Publications] Osawa, H. et al.: "Systematic search for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 5' flanking region of the human phosphodiesterase 3B gene : Absence of evidence for major effects of identified polymorphisms on susceptibility to Japanese type 2 diabetes."Mol Genet Metab. 79. 43-51 (2003)
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[Publications] Osawa, H. et al.: "Systematic search for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the FOXC2 gene : The absence of evidence for the association of three frequent SNPs and fourcommon haplotypes with Japanese type 2 diabetes."Diabetes. 52. 562-567 (2003)
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[Publications] Ochi, M. et al.: "The absence of evidence for major effects of the frequent SNP 299G>A in the resistin gene on susceptibility to insulin resistance syndrome associated with Japanese type 2 diabetes."Diabetes Res Clin Pract. 61. 191-198 (2003)
