光学活性な二核鉄錯体による部位特異的な二本鎖DNA切断と人工制限酵素への応用

2003 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 14572034
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: 黒崎 博雅 熊本大学, 大学院・医学薬学研究部, 助教授 (70234599)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 後藤 正文 熊本大学, 大学院・医学薬学研究部, 教授 (50080180)
• Keywords: 鉄錯体 / DAN切断 / 光学活性 / 電子スペクトル

Research Abstract

本研究は標的生体高分子に二本鎖DNAを選び,光学活性なジアミンから誘導される二核鉄錯体による二本鎖DNAの目的位置を選択的に切断する人工制限酵素の開発を行い染色体DNAの機能制御を目指す.
1,8-anthracenedialdhydeとN',N'-dipyridylmethyl-R,R-cyclohexane-1,2-diamineとから誘導される光学活性な複核配位子1,8-(N-anthranylmethyl)-bis(N',N'-dipyridylmethyl-R,R-cyclohexane-1,2-diamine)(1)を合成した。構造の帰属はNMR、質量分析により決定した。
pUC19プラスミドDNA0.57μgを用い、50mMトリス塩酸緩衝液中アスコルビン酸存在下1及び硫酸第一鉄(モル比1:2)を混合し(以後鉄錯体1と呼ぶ)37℃で1時間インキュベートした。その後エチジウムブロマイド含有1%アガロースゲルを用いて電気泳動を行い、蛍光強度比からDNA切断活性能を評価した。実験は全て空気中で行った。
1)鉄錯体1の濃度が5μMでは完全にForm Iの消失が観測された。
2)次にインキュベート時間とDNA切断反応の関係を調べたところ、鉄錯体1はインキュベート直後からForm IIIが生成した。反応開始1分後form Iが消失し30分後では完全にForm IIIだけが観測された。
次にpUC19DNAを用いPCR法により調製した253塩基対フラグメントを用いてDNA切断を行った。鉄錯体1はAT-richな部位を切断していることがわかった。
これらの結果から、鉄錯体1はDNAの二本鎖を同時に、かつ、塩基特異的に切断している可能性が高いと考えられる。

Research Products

• [Publications] Masafumi Goto, Katsutoshi Tanaka, Masamitsu Sumimoto, Hiromasa Mori, Hiromasa Kurosaki: "Preparation of Ternary Platinum(II) Complexes with N-(ω-Phenylalkyl)-1,2-ethanediamine and 2,2'-Dipyridine and the Effect of the Methylene Chain Length of the N-(ω-Phenylalkyl)-1,2-ethanediamine in the Complexes on Intermolecular Interactions with Various Arylslfonates"Chem.Pharm.Bull.. 51(6). 649-653 (2003)
• [Publications] Masafumi Goto, Yuuichiro Yamamoto, Masamisu Sumimoto, Nobuhiro Tsuruda, Hiromasa Kurosaki: "Conformation of 2-Aminomethylpyrrolidine and 2-Aminomethylpiperidine in Ternary Platinum(II) Complexes : Regulation of Conformation of the Diamine by the Coexisting Ligand"Chem.Pharm.Bull.. 51(10). 1157-1162 (2003)
• [Publications] Hiromasa Kurosaki, Toshiaki Tawada, Satomi Kawasoe, Yoko Ohashi, Masafumi Goto: "Crystal Sturucture of Chloro{N-mercaptoethyl[bis(6-methyl-2-pyridyl-methyl)amine]}zinc(II) Complex"Anal.Sci.. 19. x27-x28 (2003)
• [Publications] Masafumi Goto, Hisashi Tsutsui, Syuuichi Matsuda, Yoshitomo Tanaka, Nobuhiro Tsuruda, Hiromasa Kurosaki: "Structures of Platinum(II) Complexes of 2-Aminomethylaziridine and S-2-Aminomethylazetidine and Correlation of Anticancer Activities of (2-Aminomethylazacycloalkane)platinum(II) Complexes with the Geometry of the Chilate Rings Formed with Platinum(II)"Chem.Pharm.Bull.. 52(1). 47-50 (2004)
• [Publications] Masafumi Goto, Yasuhiko Ohse, Sayuri Koga, Yuka Kudo, Rinko Kukihara, Hiromasa Kurosaki: "Preparations of Low-Spin Tetra Cyano Iron Complexes of N-Benzyl-1,2-ethanediamine and Its Oxidative Dehydrogenation : Isolation of the Intermediate with Monoimine Ligand"Cull.Chem.Soc.Jpn. 77(5)(印刷中). (2004)