2003 Fiscal Year Annual Research Report

DNAの構造的性質に基づくゲノムクロマチンの構築原理の解明

Research Project

Project/Area Number	14572079
Research Institution	Meisei University
Principal Investigator	清水光弘明星大学, 理工学部, 助教授 (80231364)
Keywords	クロマチン / ヌクレオソーム / DNA構造 / 転写制御 / 反復配列 / 出芽酵母 / ゲノム
Research Abstract	本研究は、DNAの構造的性質に基づいたゲノムクロマチンの構築とその遺伝子発現制御における役割を明らかにすることを目的としており、以下の二つの観点から研究を展開した。 1.特殊なDNA構造によるクロマチンの改変を利用した転写制御機構の解析:出芽酵母α細胞ではa-細胞特異的遺伝子(BAR1など)はα2/Mcm1Pによって抑制されており、そのプロモーターではヌクレオソームがポジショニングしている。本研究において、非B型構造を形成するpoly dA・poly dT、poly dG・poly dC配列をBAR1プロモーターに挿入したところ、BAR1の脱抑制が起こりα-factorが分解された。この結果は、ヌクレオソームポジショニングが転写抑制に重要な役割を果たしていることを示しているとともに、DNA構造に基づくヌクレオソーム配置の改変によってin vivoで転写活性を制御できる可能性を提示している。 2.トリプレットリピート配列の特殊DNA構造とクロマチンの構築:ゲノムの反復配列とクロマチンの構築という観点から、神経筋疾患遺伝病の原因となるトリプレットリピート配列のクロマチン構造の特徴について研究を進めている。今年度は、Friedreich運動失調症の原因となるGAAリピートに焦点を絞った。近年、GAAリピートは三重鎖DNAを基盤としたsticky DNA構造を形成することが報告されており、Friedreich失調症との関連が注目されている。今回、様々な長さの(GAA)_n(n=12,23,89,126)をヌクレオソーム中央部位またはヌクレオソームフリー領域に挿入したミニ染色体を構築して、そのクロマチン構造を解析した。その結果、GAAリピートが長くなるほど、ミニ染色体におけるヌクレオソームポジショニングが破壊されることが示され、sticky DNAの形成との関連が示唆された。

Research Products
(5 results)

All Other

All Publications (5 results)

[Publications] Mitsuhiro Shimizu: "Yeast Ume6p repressor permits activator binding but restricts TATA-box binding protein association with the HOP1 promoter"Nucleic Acids Res.. 31・12. 3033-3037 (2003)
[Publications] Hiroshi Yoshioka: "Separation and recovery of DNA fragments by electrophoresis through a thermoreversible hydrogel of multiplied block copolymers composed of poly (ethylene oxide) and poly (propylene oxide)"Anal.Biochem.. 323・2. 218-223 (2003)
[Publications] Katsuki Ono: "The linker histone homolog Hho1p from Saccharomyces cerevisiae represents a winged helix-turn-helix fold as determined by NMR spectroscopy"Nucleic Acids Res.. 31・24. 7199-7207 (2003)
[Publications] Yoichi Shibusawa: "Purification of single-strand DNA binding protein from an Escherichia coli lysate using counter-current chromatography, partition and precipitation"J.Chromatogr.B. 793・2. 275-279 (2003)
[Publications] Mitsuhiro Shimizu: "Hap1p photofootprinting as an in vivo assay of repression mechanism in Saccharomyces cerevisiae"Methods in Enzymology (S.L.Adhya and S.Garges., eds). 370. 479-487 (2003)

2003 Fiscal Year Annual Research Report

DNAの構造的性質に基づくゲノムクロマチンの構築原理の解明

Principal Investigator

清水 光弘 明星大学, 理工学部, 助教授 (80231364)

Research Products

[Publications] Mitsuhiro Shimizu: "Yeast Ume6p repressor permits activator binding but restricts TATA-box binding protein association with the HOP1 promoter"Nucleic Acids Res.. 31・12. 3033-3037 (2003)

[Publications] Hiroshi Yoshioka: "Separation and recovery of DNA fragments by electrophoresis through a thermoreversible hydrogel of multiplied block copolymers composed of poly (ethylene oxide) and poly (propylene oxide)"Anal.Biochem.. 323・2. 218-223 (2003)

[Publications] Katsuki Ono: "The linker histone homolog Hho1p from Saccharomyces cerevisiae represents a winged helix-turn-helix fold as determined by NMR spectroscopy"Nucleic Acids Res.. 31・24. 7199-7207 (2003)

[Publications] Yoichi Shibusawa: "Purification of single-strand DNA binding protein from an Escherichia coli lysate using counter-current chromatography, partition and precipitation"J.Chromatogr.B. 793・2. 275-279 (2003)

[Publications] Mitsuhiro Shimizu: "Hap1p photofootprinting as an in vivo assay of repression mechanism in Saccharomyces cerevisiae"Methods in Enzymology (S.L.Adhya and S.Garges., eds). 370. 479-487 (2003)

清水光弘明星大学, 理工学部, 助教授 (80231364)