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2003 Fiscal Year Annual Research Report

X線構造に基づく好熱性放線菌α-アミラーゼのシクロデキストリン加水分解機構の解明

Research Project

Project/Area Number 14580621
Research InstitutionTokyo University Agriculture Arid Technology

Principal Investigator

神鳥 成弘  東京農工大学, 工学部, 助教授 (00262246)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 坂野 好幸  東京農工大学, 農学部, 教授 (70014959)
KeywordsX線結晶解析 / α-アミラーゼ / シクロデキストリン / 加水分解 / ミュータント酵素 / 好熱性放線菌 / グルコシド結合 / 放射光
Research Abstract

好熱性放線菌(Thermoactinomyces vulgaris R-47)は,2つのα-アミラーゼ(TVA1,TVA2)を持つ。これらは,デンプンに加えて,通常のα-アミラーゼがほとんど加水分解できない環状オリゴ糖であるシクロデキストリン(CD)やプルランをも加水分解できるという興味深い基質特異性を持つ。また,TVA1はデンプン・プルランなどの高分子量基質に,TVA2は,CD・オリゴ糖などの低分子量基質に対してよく働く。これらの酵素の加水分解機構を解明するために,前年度から引き続き平成15年度においては,以下の研究を行った。
不活性型TVA2ミュータント酵素と,α-,β-,γ-CD(それぞれグルコース単位が6,7,8)との複合体の結晶を作成し,X線結晶解析を行った。X線データは,放射光(高エネルギー加速器研究機構PF,およびSPring-8)により収集した。3.0Å程度の分解能での解析ではあるが,全ての複合体において,触媒部位へのCD結合が認められた。CD認識・加水分解機構について新たな知見を得たので現在,論文執筆中である。
TVA1不活性型ミュータント酵素とマルトヘキサオースとの複合体のX線結晶解析を行った。その結果,触媒部位とは別に,ドメインNに2箇所の基質結合が認められた。このことは,ドメインNがデンプン結合ドメインとして働き,TVA1が高分子量基質を好むことと密接に関係があると考えられる。この結果は,それを立証する生化学データとともに,論文誌に発表した。
TVA1,TVA2のX線結晶解析の結果から,CDを認識するアミノ酸を相互置換することにより,TVA1とTVA2の基質特異性の相互変換を試みた。その結果,TVA1ミュータント酵素(F313A)において,デンプン:CDに対する加水分解活性比を,野生型TVA2のものに近づけることに成功した。この結果は,論文誌に発表した。

  • Research Products

    (2 results)

All Other

All Publications (2 results)

  • [Publications] Ohtaki, A., Iguchi, A., Mizuno, M., Tonozuka, T., Sakano, Y., Kamitori.S.: "Mutual conversion of substrate specificities of Thermoactinomyces vulgarius R-47 α-amylase TVAI and TVAII by site-directed mutagenesis"Carbohydrate Research. 338. 1553-1558 (2003)

  • [Publications] Abe, A., Tonozuka, T., Sakano, Y., Kamitori, S.: "Complex structures of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-amylase 1 with malto-oligosaccharides demonstrate the role of domain N acting as a starch binding domain"J.Mol.Biol.. 335. 811-822 (2004)

URL: 

Published: 2005-04-18   Modified: 2016-04-21  

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