2002 Fiscal Year Annual Research Report
切断部位特異抗体と合成ペプチドを用いたポリペプチドC末端微量解析
Project/Area Number |
14658190
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
大海 忍 東京大学, 医科学研究所, 助教授 (20160046)
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Keywords | タンパク質 / 末端分析 / アミノ酸配列 / 一次構造 / 抗体 / プロテアーゼ / カルボキシル末端 / 質量分析 |
Research Abstract |
先に我々はカルパイン内在性阻害タンパク質カルパスタチンがアポトーシス時にカスパーゼによって切断されることを報告した.カルパスタチン断片の末端配列分析結果に基づいて切断部位特異抗体を作成し,アポトーシス細胞におけるカルパスタチンの動態解析を試みたが,カルパスタチンはさらなる分解を受けるようで抗原ポリペプチドは検出されなかった.しかし,本抗体で認識される95kDaの新たな分子が見つかった.95kDaポリペプチドは,アポトーシス特異的で阻害剤による実験結果などからもカスパーゼの切断によって生成することが強く示唆された.部分アミノ酸配列分析の結果,非骨格筋型ミオシン重鎖(A型)(MH-A)のC末端フラグメントであることが判明した.MH-AにはDAIDという配列が存在しないので,--DAID-COOH(カルパスタチン)に対して作成した抗体がMH-Aの異なった配列に結合したことになる.詳細な解析からMH-Aは,中央部分とC末端近傍の二カ所でカスパーゼによる切断を受けることがわかった.中央の切断部位はDTLD1153/STであった.C末端近傍の切断部位は,プロテインシーケンサーあるいは質量分析計を用いても,決定が難しい.抗--DAID-COOH抗体が95kDaポリペプチドのC末端に結合してイムノブロットで染色されることから,合成ペプチドによる競合実験を行った.すなわち,MH-Aにおいてカスパーゼによって切断されうる部分をC末端とするペプチドを合成し,抗--DAID-COOH抗体によるイムノブロット像に対する影響を調べた.AGDGSDEEVD-COOHが抗体と競合して免疫染色を抑える効果を示した.以上の結果から,C末端に対する切断部位特異抗体は,新規プロテアーゼ基質の探索のみならず,合成ペプチドを活用することによってC末端配列の解析にも利用できることが明らかになった.
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Research Products
(6 results)
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[Publications] Yamamoto K: "Cloning of Hamster Type XVII Collagen cDNA, and Pathogenesis of Anti-Type XVII Collagen Antibody and Complement in Hamster Bullous Pemphigoid"J Invest Dermatol. 118. 485-492 (2002)
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[Publications] Tanaka Y: "Reveromycin A inhibits antigen receptor-mediated antigen presentation by B lymphoma cells via its effect on intracellular trafficking of the antigen"J Antibiot. 55. 904-913 (2002)
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[Publications] Sakiyama H: "Characterization of mineral deposits formed in cultures of a hamster tartrate-resistant acid phosphatase (TRAP) and alkaline phosphatase (ALP)"Cell Tissue Res. 309. 269-279 (2002)
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[Publications] Niikura Y: "Monitoring of Caspase-8/FLICE Processing and Activation upon Fas Stimulation with Novel Antibodies Directed against a Cleavage Site for Caspase-8 and Its"J Biochem. 132. 53-62 (2002)
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[Publications] Nakanishi A: "Characterization of the Interaction between DNA Gyrase Inhibitor and DNA Gyrase of Escherichia coli"J Biol Chem. 277. 8949-8954 (2002)
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[Publications] Azumi H: "Superoxide generation in directional coronary atherectomy specimens of patients with angina pectoris : important role of NAD(P)H oxidase"Arterioscler Thromb Vasc Biol. 22. 1838-1844 (2002)