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2015 Fiscal Year Annual Research Report

ビタミンB12含有酵素の反応性制御法を模したユニークな新規生体触媒の開発

Research Project

Project/Area Number 14J00790
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

森田 能次  大阪大学, 工学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2014-04-25 – 2016-03-31
Keywordsメチオニン合成酵素 / メチル基転移反応 / コバラミン / 再構ミオグロビン / コバルトテトラデヒドロコリン
Outline of Annual Research Achievements

コバラミン依存型メチオニン合成酵素は、生体内で重要なメチル基転移反応を司っている。 しかしながら、タンパク質部分が巨大かつ、補欠分子の分子構造が複雑であるため、反応中間体であるコバルト1価種の構造やタンパク質内でのメチル基転移反応の詳細なメカニズムは完全には理解されていない。 本研究では、酵素のタンパク質部分を含めた酵素モデルとして、ヘムタンパク質であるミオグロビンから天然ヘムを取り除いたアポミオグロビンにコバラミンのモデル錯体を挿入した再構成ミオグロビンを調製し、酵素類似のメチル基転位反応を評価することで、天然酵素における反応促進のメカニズム解明をめざしている。
本年度は、酵素類似のモデル反応としてタンパク質マトリクス内でのメチル錯体の生成反応およびメチル基転移反応を実施した。 コバルト1価種を含む再構成ミオグロビン溶液にヨードメタンを添加することで、タンパク質内でメチル錯体を生成した。 有機溶媒中では同様の反応が進行しないことから、His93の軸配位によるメチル錯体の安定化を明らかにした。 さらに、生成したメチル錯体のメチル基は室温でHis64のイミダゾール窒素へ転移することを見出した。 また本酵素モデルにおける理論計算は、これまでに提唱されている協奏的な反応機構よりもHis93が脱配位した5配位構造のHis-off中間体を経由する反応機構の方が活性化エネルギーが低く、より有利に反応が進行することを示唆した。
次に、不安定なメチル錯体のモデルとして、安定なアクア及びシアノコバルト3価錯体を含む再構成ミオグロビンを新たに調製し、X線結晶構造及び配位挙動を詳細に評価した。 シアノコバラミンと比較すると、調製したシアノ錯体のCo-N(His93) 結合距離が長いことから、実際の酵素では、メチル基転移反応を加速させるHis-off中間体の生成が促進されていることを示唆した。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (7 results)

All 2016 2015

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] Intraprotein transmethylation via a CH3-Co(III) species in myoglobin reconstituted with a cobalt corrinoid complex2016

    • Author(s)
      Yoshitsugu Morita, Koji Oohora, Akiyoshi Sawada, Kazuki Doitomi, Jun Ohbayashi, Takashi Kamachi, Kazunari Yoshizawa, Yoshio Hisaeda and Takashi Hayashi
    • Journal Title

      Dalton Transactions

      Volume: 45 Pages: 3277-3284

    • DOI

      10.1039/C5DT04109K.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Crystal Structures and Coordination Behaviors of Aqua- and Cyano-Co(III) Tetradehydrocorrins in the Heme Pocket of Myoglobin2016

    • Author(s)
      Yoshitsugu Morita, Koji Oohora, Eiichi Mizohata, Akiyoshi Sawada, Takashi Kamachi, Kazunari Yoshizawa, Tsuyoshi Inoue and Takashi Hayashi
    • Journal Title

      inorganic Chemistry

      Volume: 55 Pages: 1287-1295

    • DOI

      10.1021/acs.inorgchem.5b02598

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Crystal Structures and Coordination Behavior of Aqua- and Cyano-Co(III) Tetradehydrocorrin in a Myoglobin Matrix2016

    • Author(s)
      森田能次・大洞 光司 ・澤田明純・蒲池高志・吉澤 一成・林 高史
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      同志社大学(京都府京田辺市)
    • Year and Date
      2016-03-24 – 2016-03-24
  • [Presentation] Myoglobin Reconstituted with Cobalt Tetradehydrocorrin as a Functional Model of Methionine Synthase2016

    • Author(s)
      森田能次・大洞 光司 ・林 高史
    • Organizer
      BIOTECHNOLOGY AND CHEMISTRY FOR GREEN GROWTH
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2016-03-10 – 2016-03-10
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Myoglobins reconstituted with cobalt tetra- and bis-dehydrocorrins as a methionine synthase model2015

    • Author(s)
      森田能次・大洞 光司 ・林 高史
    • Organizer
      Pacifichem 2015 Conference
    • Place of Presentation
      ハワイコンベンションセンター(アメリカ・ホノルル)
    • Year and Date
      2015-12-17 – 2015-12-17
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Transmethylation in the heme pocket of myoglobin reconstituted with cobalt corrinoids as a methionine synthase mode2015

    • Author(s)
      森田能次・大洞 光司 ・林 高史
    • Organizer
      錯体化学会第65回討論会
    • Place of Presentation
      奈良女子大学(奈良県奈良市)
    • Year and Date
      2015-09-22 – 2015-09-22
  • [Presentation] Transmethylation in Myoglobins Reconstituted with Cobalt Corrinoids as a Methionine Synthase Model2015

    • Author(s)
      森田能次・大洞 光司 ・林 高史
    • Organizer
      "Metals in Biology" in Wako
    • Place of Presentation
      理化学研究所(埼玉県和光市)
    • Year and Date
      2015-06-17 – 2015-06-17
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2016-12-27  

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