2015 Fiscal Year Annual Research Report
メチローム解析による試験管内始原生殖細胞誘導過程における遺伝子発現制御機構の解明
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14J04310
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
白根 健次郎 九州大学, 医学系学府, 特別研究員(DC1)
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| Project Period (FY) |
2014-04-25 – 2017-03-31
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| Keywords | DNAメチル化 / エピゲノム / 始原生殖細胞 / 多能性幹細胞 / リプログラミング / 次世代シークエンサー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は胚性幹細胞から誘導された始原生殖細胞様細胞をモデルとし、始原生殖細胞形成過程のDNAメチル化制御とその遺伝子発現への影響を明らかにすることを目的としている。本年度は、昨年度にデータ取得の終了した胚性幹細胞、エピブラスト様細胞、始原生殖細胞様細胞の全ゲノムDNAメチル化データと全転写物データを統合して解析した。胚性幹細胞では多能性維持に関わる遺伝子周囲のDNAは低メチル化し、遺伝子発現の活性化と関わっているのに対して、始原生殖細胞様細胞では体細胞で発現する体節形成遺伝子周囲を低メチル化するが、他の抑制性修飾の一つH3K27me3を導入することでその発現抑制を保つことが分かった。つまり、胚性幹細胞では活性化される遺伝子周囲のDNAメチル化を除いて遺伝子活性化複合体を呼び込む足場を作るのに対して、始原生殖細胞様細胞は抑制される遺伝子周囲のDNAメチル化を除いて遺伝子抑制複合体を呼び込む足場を作ることが示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
３年目に予定していたDNAメチル化と遺伝子発現の統合的な解析まで終了したため。
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| Strategy for Future Research Activity |
始原生殖細胞様細胞では体細胞で発現する体節形成遺伝子周囲を低メチル化し、ポリコーム複合体をリクルートすることで抑制状態を保つことが分かった。これら遺伝子の積極的なDNA脱メチル化に関わる因子を明らかにしたい。
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Research Products
(8 results)
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[Journal Article] De novo DNA methylation drives 5hmC accumulation in mouse zygotes.2016
Author(s)
Amouroux, R., Nashun, B., Shirane, K., Nakagawa, S., Hill, P.W., D'Souza, Z., Nakayama, M., Matsuda, M., Turp, A., Ndjetehe, E., Encheva, V., Kudo, N.R., Koseki, H., Sasaki, H. & Hajkova, P.
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Journal Title
Nature Cell Biology
Volume: 18
Pages: 225-233
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] DNA methylation and gene expression dynamics during spermatogonial stem cell differentiation in the early postnatal mouse testis2015
Author(s)
Kubo, N., Toh, H., Shirane, K., Shirakawa, T., Kobayashi, H., Sato, T., Sone, H., Sato, Y., Tomizawa, S., Tsurusaki, Y., Shibata, H., Saitsu, H., Suzuki, Y., Matsumoto, N., Suyama, M., Kono, T., Ohbo, K., Sasaki, H.
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Journal Title
BMC Genomics
Volume: 16
Pages: 624
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Analysis of influenza A/H3N2 neuraminidase genes obtained from influenza patients in the 2011/12 and 2012/13 seasons in Japan2015
Author(s)
Ikematsu, H., Chong, Y., Shirane, K., Toh, H., Sasaki, H., Koga, Y., Matsumoto, S., Hotta, T., Uchiumi, T., Kang, D.
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Journal Title
Fukuoka Acta Medica
Volume: 106
Pages: 16-22
Peer Reviewed
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[Journal Article] Analysis of the Neuraminidase Amino Acid Sequences of Influenza A/H1N1pdm09, A/H3N2, and B Viruses Isolated from Influenza Patients in the 2013/14 Japanese Influenza Season2015
Author(s)
Ikematsu, H., Chong, Y., Shirane, K., Toh, H., Sasaki, H., Koga, Y., Matsumoto, S., Hotta, T., Uchiumi, T., Kang, D.
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Journal Title
Fukuoka Acta Medica
Volume: 106
Pages: 231-239
Peer Reviewed
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